Журнал гликомики и липидомики
Открытый доступ

Абстрактный

Высокая частота геномных мутаций лежит в основе успешного распространения полирезистентного штамма Mycobacterium tuberculosis Lineage 4 Haarlem.

Наира Дехил

Понимание того, как возникает и распространяется туберкулез с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ-ТБ), особенно в ВИЧ-отрицательном контексте, может помочь в расшифровке факторов, способствующих возникновению этой бациллы. Здесь мы тщательно изучили популяционную структуру генотипа Mycobacterium tuberculosis lineage 4 (L4)-Haarlem в Северном Тунисе, где он с самого начала вызвал крупную вспышку МЛУ-ТБ среди ВИЧ-отрицательных молодых людей. Для этой цели мы обеспечили 11-летний полный охват генотипа Haarlem в эпидемическом регионе, проанализировав все изоляты M. tuberculosis, демонстрирующие сигнатуру сполиготипа Haarlem (N = 253). Мы провели 24-локусное типирование MIRU-VNTR (множественные вкрапленные повторяющиеся единичные переменные числа тандемных повторов) и секвенировали весь геном 94 репрезентативных изолятов. Затем были проведены различные популяционно-генетические и эволюционные анализы. Мы раскрыли склонность генотипа Haarlem к эпидемическому распространению, независимо от модели восприимчивости к препаратам (общая недавняя скорость передачи 83%). Общая эпидемия MDR-TB была связана с одним восприимчивым к препаратам клоном-предшественником, существование которого датируется 124 годами. Поразительно, но была оценена общая высокая скорость мутаций, близкая к таковой у глобально распространенной сублинии L2-Beijing, что согласуется с почти одновременным приобретением множественной лекарственной устойчивости и компенсаторных мутаций. Такая высокая скорость мутаций также объясняет повышенное количество нуклеотидных различий между геномами изолятов от пациентов с установленными эпидемиологическими прямыми связями. В заключение, наши данные раскрыли относительно высокую скорость мутаций генотипа Haarlem, эволюционирующего в Северном Тунисе, неотъемлемую отличительную черту, которая, скорее всего, способствовала появлению успешно переданных клонов MDR посредством быстрого приобретения компенсаторных мутаций. Если не сдержать этот быстро развивающийся клон Харлема, который в настоящее время остается географически ограниченным, может представлять угрозу для евро-средиземноморского пространства.