Журнал противовирусных и антиретровирусных препаратов
Открытый доступ

Абстрактный

Инфекция вируса ГБ С среди населения Литвы, инфицированного вирусом гепатита С (ВГС)

Валинчуте А, Киверите С и Маурикас М

Предыстория: Вирус GB C (GBV-C), также известный как вирус гепатита G (HGV), представляет собой оболочечный вирус с одноцепочечной РНК длиной генома около 9,4 Кб. На основании сходства структуры генома с HCV вирус GBV-C классифицируется как вирус семейства Flaviviridae. Вирус GBV-C имеет всемирное распространение, и вирусные инфекции распространены среди здоровых доноров крови, а также среди лиц с ослабленным иммунитетом. Предыдущие исследования показали высокий уровень коинфекции GBV-C у лиц, инфицированных вирусом гепатита C (HCV) и вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ). На основании генетических различий между последовательностями 5′ нетранслируемой области (5′UTR) изолятов GBV-C вирус классифицируется на семь основных генотипов и несколько подтипов. Распределение генотипов GBV-C варьируется в зависимости от географического положения, и информация по-прежнему неполна. Целью данного исследования было определение частоты GBV-C и генотипов GBV-C среди лиц с положительным результатом на вирус гепатита С в Литве.
Методы: В данном исследовании РНК GBV-C была выделена из образцов сыворотки 170 пациентов с известной инфекцией вируса гепатита С. Для синтеза комплементарной ДНК (кДНК) использовалась вложенная реакция обратной транскриптазы, а фрагмент из 210 п.н. из области 5′UTR был амплифицирован с помощью вложенной ОТ-ПЦР. Продукты ПЦР были секвенированы и подвергнуты филогенетическому анализу с использованием референтных последовательностей из каждого генотипа, полученных из GenBank (n=46). Анализ был выполнен с использованием CLC bio версии 6.6.5 и MEGA 5.2.
Результаты: Среди 170 пациентов с положительным результатом на вирус гепатита С 36 (21,17%) были положительными на GBV-C. На основе филогенетического анализа короткого региона (210 пн) в регионе 5′UTR были классифицированы два генотипа, 2a и 3.
Выводы: В этом исследовании была обнаружена высокая частота генотипа GBV-C 2a у литовских пациентов с положительным статусом HCV. Наличие генотипа 3 может быть связано с географическим положением и историей Литвы.