Передовые методы в биологии и медицине
Открытый доступ

Абстрактный

Геномные базы данных и программное обеспечение: в поисках биологической значимости с помощью биоинформатики

Махима Кошик, Свати Махендру, Мохан Кумар, Свати Чаудхари и Шрикант Кукрети

С завершением проекта генома человека стало доступно множество информации для изучения различных нерешенных вопросов, связанных с клеточной и молекулярной биологией. Биоинформатика сыграла важную роль в раскрытии генетических, фенотипических, структурных и функциональных аспектов всего генома с помощью этой информации. Геномика и протеомика стали одними из самых актуальных областей после достижений в области вычислительного анализа, интерпретации и программного обеспечения для моделирования. Она может не только довольно категорично описывать положение нуклеотидов и аминокислот в геномах и протеомах соответственно, но и помогает в выполнении филогенетического анализа, поиске связанных факторов транскрипции, множественных выравниваниях последовательностей и многих других соответствующих исследованиях/охотах. Достижения в знаниях генетики, полученные из молекулярной биологии и биоинформатики, применяются и указывают на потенциальные терапевтические стратегии, такие как редактирование генома. Целью этого обзора является обсуждение некоторых баз данных и программного обеспечения биоинформатики, которые использовались для исследования положения последовательности ДНК, любого связанного с заболеванием полиморфизма одного нуклеотида (SNP), на или вблизи расположенных сайтов связывания факторов транскрипции с последующим множественным выравниванием последовательности этой последовательности с другими организмами. Это исследование дает представление о функциональных элементах любой последовательности ДНК, РНК или белка перед исследованием структурного полиморфизма, который может регулировать экспрессию генов. Кроме того, в этом обзоре кратко обсуждаются инструменты, используемые для программируемой технологии редактирования генома на основе нуклеазы.