Журнал теоретических и вычислительных наук
Открытый доступ

Абстрактный

Насколько мы далеки от природы? Анализ корреляционных сходств между дескрипторами банка лекарств и молекулами трипептидов

Эйтнер К., Гавада Т., Кох У.

Был проведен статистический анализ сходства между 2D топологическими дескрипторами из базы данных молекул Drug Bank и 8000 трипептидов (все возможные комбинации аминокислот, кодируемые нуклеиновыми кислотами). Корреляция между теоретически рассчитанными свойствами молекул трипептидов (MW, AlogP, топологический PSA, доноры водородных связей и акцепторы водородных связей) и топологическими дескрипторами из Drug Bank показала большое сходство между простыми трипептидами и соединениями с выделенной биологической активностью, разработанными в лабораториях. В статье представлены гистограммы распределения количества соединений со схожими свойствами молекул, кодируемых дескрипторами. В нашем исследовании была разработана простая инновационная методология для крупномасштабного анализа статистических данных и их корреляции. Некоторые гипотезы указывают на то, что высокообработанная пища является естественным антибактериальным и противовирусным барьером. Наше исследование в сравнении с литературными данными доказывает, что многие ксенобиотики топологически похожи на природные метаболиты, являющиеся трипептидами, и некоторые из них имеют схожее терапевтическое применение.