Иммунные исследования
Открытый доступ

Абстрактный

Иммуноинформационный подход к созданию пептидной вакцины на основе эпитопа против гликопротеина G вируса бешенства Лагос

Омар Хашим Ахмед, Арва Абдельхалим, Сахар Оби, Хубиб Али Абд Эльрахман, Ахмед Хамди и Мохаммед А. Хасан

Предыстория: Вирус бешенства Лагос принадлежит к роду лиссавирусов, ответственных за менингоэнцефаломиелит у млекопитающих, который поражает миллионы людей по всему миру и ежегодно становится причиной тысяч человеческих смертей. Насколько нам известно, пептидной вакцины, разработанной для вируса бешенства Лагос, не существует. Ожидается, что полученная пептидная вакцина будет более иммуногенной и менее аллергичной, чем обычные биохимические вакцины. Целью данного исследования была разработка пептидной вакцины Insilco для вируса бешенства Лагос с использованием иммуноинформационных инструментов.
Методы и материалы: Последовательности гликопротеина G вируса бешенства Лагос были получены из NCBI, затем полученные последовательности были обработаны с использованием различных иммуноинформационных инструментов для В-клеток, чтобы найти наиболее консервативные, поверхностные и антигенные эпитопы, и для Т-клеток, чтобы найти консервативные пептиды и проверить их связывающую аффинность с различными аллелями MHC1 и MHC11. Затем был проведен анализ охвата популяции и моделирование гомологии для наиболее перспективных эпитопов, чтобы показать их структурные позиции в гликопротеине G.
Результаты и выводы: Тесты В-клеток были проведены для Bepipred с 22 консервативными эпитопами, прогнозирование доступности поверхности Emini с 12 консервативными поверхностными эпитопами и тест антигенности Kolaskar и Tongaonkar, в котором только три консервативных эпитопа были антигенными. 23 консервативных эпитопа взаимодействовали с различными аллелями MHC-1 с (IC50) ≤ 500, в то время как 39 консервативных эпитопов взаимодействовали с аллелями MHC-II с IC50 ≤ 1000. Среди всех протестированных эпитопов для охвата мировой популяции связывание эпитопа FVGYVTTTF с аллелями MHC1 и MHC11 составило 97,30%, и было обнаружено, что он связывается с 13 различными аллелями, что указывает на высокий потенциал для разработки пептидной вакцины против вируса бешенства Лагос.