Микобактериальные заболевания
Открытый доступ

Абстрактный

Снижение уровня загрязнения ПЦР/ампликонами в референтной лаборатории с высоким риском и высокой нагрузкой на микобактерии в условиях ограниченных ресурсов

Прашанта Кумар Дас*, Сомтиртха Б. Гангули и Бодхисатья Мандал

Предыстория: Методы амплификации нуклеиновых кислот стали важными механизмами в диагностике ряда заболеваний в клинических лабораториях. Загрязнение ПЦР/Загрязнение ампликонами, приводящее к ложноположительным результатам, остается серьезной проблемой в этих лабораториях. Профилактика этих загрязнений при создании этих лабораторий молекулярной биологии была очень важна на протяжении многих лет. Хотя закрытые системы ПЦР существенно снижают уровень загрязнения ПЦР, традиционные методы гибридизации на основе зондов продолжают демонстрировать возникновение загрязнения по разным причинам.

Исследование включало проверку важнейших параметров, а также вероятных кандидатов на возможность заражения при высокой нагрузке. Приоритетной задачей было выявление наиболее эффективных вмешательств в контроле заражённости ПЦР для будущих начинаний. В исследовании изучалась эффективность различных наборов вмешательств, способствующих процессу снижения заражённости.
Материалы и методы: Обнаружение загрязняющих продуктов ПЦР или ампликонов или заражающих организмов выполняется с помощью наборов Genotype MTBDR plus V2 (Hains Life Sciences) на основе технологии ДНК-полосок.
Результаты: Предварительная и последующая очистка, а также очистка рабочих поверхностей позволили снизить средний процент заражения на 36,5%. Совместный эффект очистки рабочих поверхностей, автоматических пипетирующих устройств и машин переменного тока вместе с их фильтрами позволил снизить средний процент заражения до 53,5%, снизив скорость заражения почти до 94,6% (средний процент заражения составил 56,5% при контрольном запуске).