Журнал теоретических и вычислительных наук
Открытый доступ

Абстрактный

Молекулярное моделирование и анализ стыковки CYP1A1, связанного с раком головы и шеи, для изучения его областей связывания

Шейх Арслан Сегал, Рана Аднан Тахир, Шагуфта Шафик, Мубашир Хасан и Саджид Рашид

Цитохром P450, семейство 1, подсемейство A, полипептид 1 — фермент фазы I суперсемейства цитохромов P-450 (CYP), участвующий в детоксикации или преобразовании канцерогенов в более электрофильную форму, метаболизируемую ферментами фазы II. Эти детоксицирующие ферменты широко изучались в связи с раком головы и шеи. Для моделирования CYP1A1 и его оценки применяются многочисленные биоинформатические инструменты. Моделирование на основе гомологии из шаблона 2HI4 было выполнено с помощью биоинформатического программного обеспечения MODELLER 9v10. Все инструменты оценки подтвердили надежность предсказанной модели. Для исследований связывания были выявлены связывающие карманы. Ингибитор (C6H13FN2O2) показал максимальную связывающую аффинность против CYP1A1. Исследования стыковки показали, что Leu-21, Val-22, Phe-23, Gly-42, Pro-43, Gly-45, His-51, Gln-75 и Ile-76 являются критическими остатками для взаимодействия рецептора с лигандом. Мы предполагаем, что предсказанная структура надежна для структурных идей и функциональных исследований, а выбранный ингибитор может быть более эффективным для рака головы и шеи. Дальнейший анализ этого ингибитора с помощью направленного мутагенеза может быть полезен для изучения деталей карманов связывания лиганда. В целом, результаты этого исследования могут быть полезны при разработке новых терапевтических мишеней для лечения рака головы и шеи.