Журнал клинической и клеточной иммунологии
Открытый доступ

Абстрактный

Филогенетика типа власти хозяина, активированных в шелкопряде Bombyx mori в ответ на заражение двукрылыми эндопаразитоидами, выявила функциональную дивергенцию и временную молекулярную адаптивную эволюцию.

Прадип А.Р., Анита Дж., Панда А., Пуджа М., Авасти А.К., Гита Н.М., Поннувель К.М. и Триведи К.

Гетерогенная группа из 19 рычагов механизма хозяина была активирована в коммерческом важном шелкопряде Bombyx mori после заражения двукрылым паразитоидом Exorista Bombycis . Белки включают компоненты путей Toll и меланизации, регуляторы аутофагии и апоптоза, шапероны, цитокины и протеолитические ферменты. Мы открыли филогенетическую связь внутри каждого белка состояния хозяина, при фундаменте, что он будет разным отрядам планеты. Многократное бегство последовательностей с большинством подобных последовательностей показывает большую долю консерваций аминокислот в белках стресса, компонентах меланизации, кактусе, хитиназе и аутофагии 5 – стандартные, тогда как сигнальные формы и цитокины, показывают ~30% консервации аминокислот. Филогенетический анализ белков выявил дивергенцию, которая является адаптивным механизмом защиты от атак паразитов. Для анализа филогенетических положений источник источника аминокислотных последовательностей всех белков из B. mori и последовательностей из репрезентативных цепочек были выровнены и построено филогенетическое дерево на основе метода максимального правдоподобия с использованием программы MEGA 5.05. Значения бутстрепа для метода строительства деревьев были получены из 1000 репликатов. Филогенетическое дерево выявило три кластера. На филогенетическом кластере A обнаружена ранняя дивергенция каспазы и более поздняя дивергенция BmToll, поскольку кластер B показал раннюю дивергенцию фермента, активного профенолоксидазу (PPAE), через независимую линию. Экспрессия PPAE выявила плейотропную корреляцию с различными генами, что указывает на инициацию различных иммунных процессов PPAE в различных временных точках эволюционного древа. Факторы транскрипции NF κB, дорсальный и приправа расходуются с общими предком с высокими значениями бутстрепа (83%), однако наблюдается 58% аминокислотного сходства. Релиш показал длинные вставки, раскрывающие аминокислотные вариации дорсальной части. Кластер C проиллюстрировал расхождение аутофагии 5-подобного, апоптоз-индуцирующего фактора и профенолоксидазы во временном режиме для начальной защиты клеток или для индукции запрограммированной последней клетки на более поздних стадиях паразитизма.