Транскриптомика: открытый доступ
Открытый доступ

Абстрактный

Анализы изображения и экспрессии генов халконсинтазы (CHS) и антоцианидинсинтазы (ANS) в Clivia miniata

Миров AW

Халконсинтаза (CHS) и антоцианидинсинтаза (ANS) являются одними из ключевых белков, ответственных за
создание антоцианов в растениях. Они в целом кодируются многокачественными семействами для определенных особей
из этих семейств, добавляя пигментацию оттенка. Исследование проверило качества CHS и ANS в Clivia
miniata; чьи цветущие ткани претерпевают изменения оттенка. РНК в кДНК была отделена от ботанических
тканей, и три уникальных гена (CmiCHS 11996, CmiCHS 43839 и CmiANS) короткой длины последовательности были впервые
получены с использованием метода будущего секвенирования. Качественные явные основы были запланированы из неопубликованных
начальных коротких последовательностей CHS и ANS. Длина усиленной кДНК после ПЦР составила CmiCHS 11996
(933 п.н.), CmiCHS 43839 (951 п.н.) и CmiANS (983 п.н.). В начале была сделана интерпретация контура ORF
по сравнению с ожидаемым белком 390 аминокислот, вызывающих коррозию, обоснованным белком (AEN04070) для качеств CHS,
и ожидаемым 355 аминокислот, вызывающих коррозию, в отношении качества ANS (AGD99672). Исследование in silico выявило
определенный субатомный вес и гипотетическую изоэлектрическую точку (pI) CmiCHS 11996 и CmiCHS43839, которые составили
31,0 кДа - 6,95 и 34,6 кДа - 7,54 отдельно. Значимые темы сайта ограничения элемента и динамического сайта
были эффективно распознаны из обоснованных аминокислотных последовательностей. Различное расположение групп показало
, что последовательности CmiCHS и CmiANS были исключительно сохранены и разделяли высокий характер расположения
(>83%) с халконсинтазами из разных растений. Тем не менее, было проведено еще одно исследование, чтобы определить
профили сочленения этих качеств в различных тканях, таких как околоцветники (оранжевый и желтый цветок), используя
постоянную количественную ПЦР. Уровни сочленения CmiCHS и CmiANS были выше в околоцветниках по сравнению
с другими тканями (листья, столбик и стыд, а также черешок). Эти примеры сочленения качеств в тканях
по сравнению с накоплением антоциана, предполагая, что оранжевый и желтый цвета штриховки были положительно
идентифицированы с руководством халконсинтазы, а также антоциансинтазы.