Иммунные исследования
Открытый доступ

Абстрактный

Последние достижения в вычислительной идентификации участков N 6 -метиладенозина в Saccharomyces cerevisiae

Kuo-Chen Chou

N ⁶ -метиладенозин (m ⁶ A) играет важную роль в широком наборе биологических процессов. Знание точного местоположения сайта m ⁶ A в транскриптоме имеет жизненно важное значение для расшифровки его биологических функций. Хотя экспериментальные методы внесли существенный вклад в идентификацию метилирований m ⁶ A, они по-прежнему трудоемки, дороги и требуют много времени. В качестве хороших дополнений к экспериментальным методам в последние несколько лет был предложен ряд вычислительных подходов для идентификации сайтов m ⁶ A в Saccharomyces cerevisiae . Чтобы помочь исследователям выбрать подходящие методы для идентификации сайтов m ⁶ A, необходимо дать всесторонний обзор и сравнение существующих вычислительных методов. В этом обзоре мы обобщили текущий прогресс в вычислительном прогнозировании сайтов m ⁶ A, а также оценили производительность вычислительных методов для идентификации сайтов m ⁶ A на независимом наборе данных. Наконец, были также представлены проблемы и будущие направления вычислительной идентификации сайтов m ⁶ A. В целом мы ожидаем, что этот обзор послужит важным руководством для будущего вычислительного анализа m ⁶ A и других модификаций РНК.