Разработка лекарств: открытый доступ

Разработка лекарств: открытый доступ
Открытый доступ

ISSN: 2169-0138

Абстрактный

ToxDelta: новая программа для оценки того, как различия влияют на эффект химических веществ

Азади Голбамаки, Алессио М. Франки, Серена Манганелли, Альберто Манганаро, Джузеппина Джини и Эмилио Бенфенати

ToxDelta — это новый инструмент для оценки токсичности химических веществ на основе модифицированной версии пакета fmcs_R. Две структурно схожие молекулы имеют максимальную общую подструктуру (MCS). Чтобы оценить, оказывают ли две схожие молекулы разные эффекты, мы сосредоточили свое внимание на молекулярных фрагментах, которые не входят в MCS. Эти части могут увеличивать или уменьшать значение свойства. Мы рассмотрели вариант концепции MCS эффективной релевантности в оценке токсичности, где кольца молекул не должны быть разорваны. Для оценки токсичности целевого химического вещества ToxDelta извлекает MCS и выделяет оставшиеся фрагменты. Каждый из этих фрагментов представляет собой разницу между двумя молекулами, и его релевантность в оценке токсичности оценивается по списку активных и неактивных фрагментов, основанному на знаниях. ToxDelta учитывает различия молекул в подходе «чтение поперек».

Отказ от ответственности: Этот тезис был переведен с использованием инструментов искусственного интеллекта и еще не прошел рецензирование или проверку.
Top