Журнал протеомики и биоинформатики

Журнал протеомики и биоинформатики
Открытый доступ

ISSN: 0974-276X

Инструкции для авторов

Журнал протеомики и биоинформатики обеспечивает оперативную ежемесячную публикацию статей по всем направлениям, связанным с протеомикой и биоинформатикой. Он приветствует представление рукописей, отвечающих общим критериям значимости и научного превосходства. Статьи будут опубликованы примерно через месяц после принятия.

The journal focuses on the fields of proteomics and bioinformatics which include properties and interactions of proteins, protein structure and post-translational modifications, protein structure predictions, analysis, homology modeling, epitope identification, biomarker discovery, next generation sequencing, genome annotation, analysis of gene expression, regulation with the aid of software, structural approach of bioinformatics such as molecular interaction, molecular docking and computational evolutionary biology in both prokaryotes and eukaryotes.

Отправьте рукопись в  онлайн-систему подачи или отправьте в виде приложения к электронному письму в редакцию по адресу:  рукописи@longdom.org

Номер рукописи будет отправлен соответствующему автору по электронной почте в течение 72 часов.

Заявление об этике публикаций и злоупотреблениях служебным положением

Примечание. Авторы несут единоличную ответственность за любые научные нарушения, включая плагиат в своих научных статьях; Издатель не несет ответственности за какие-либо научные недобросовестные действия, допущенные в любой опубликованной исследовательской статье. Как издатель, мы будем следовать строго научным принципам и советам главного редактора по отзыву или исправлению любой статьи в любое время, если в каких-либо статьях произошли научные недобросовестные действия или ошибки.

Политика Лонгдом издательская СЛ в отношении мандата NIH

Лонгдом издательская СЛ будет поддерживать авторов, размещая опубликованные версии статей обладателей грантов NIH в PubMed Central сразу после публикации.

Редакционная политика и процесс

Журнал протеомики и биоинформатики придерживается прогрессивной редакционной политики, поощряющей исследователей представлять оригинальные исследования, обзоры и редакционные наблюдения в виде статей, хорошо подкрепленных таблицами и графическим представлением.

Плата за обработку статьи (APC) :

Журнал протеомики и биоинформатики организован Лонгдом издательской СЛ, самофинансируемой организацией и не получает финансирования от какого-либо учреждения/правительства. Следовательно, работа журнала финансируется исключительно за счет гонораров, полученных от авторов и некоторых академических/корпоративных спонсоров. Сборы за обработку необходимы для поддержания журнала. Будучи журналом открытого доступа, Journal of Proteomics & Bioinformatics не получает плату за подписку, поскольку статьи находятся в свободном доступе в Интернете. Авторы статей обязаны платить справедливую плату за обработку своих статей. Тем не менее, нет платы за подачу. Авторы обязаны произвести оплату только после того, как их рукопись будет принята к публикации.

.

Среднее время обработки статьи (APT) составляет 45 дней.

Плата за базовую обработку статьи или стоимость обработки рукописи соответствует цене, указанной выше, с другой стороны, она может варьироваться в зависимости от обширного редактирования, цветных эффектов, сложных уравнений, дополнительного удлинения нет. страниц статьи и т.д.

Быстрое редакционное оформление и процесс рецензирования (процесс FEE-Review):

Journal of Proteomics & Bioinformatics участвует в процессе быстрого редакционного оформления и рецензирования (FEE-Review Process) с дополнительной предоплатой в размере 99 долларов США помимо обычной платы за обработку статьи. Быстрое редакционное оформление и процесс рецензирования — это специальный сервис для статьи, который позволяет получить более быстрый ответ на этапе предварительного рецензирования от редактора-обработчика, а также рецензию от рецензента. Автор может получить более быстрый ответ на предварительное рецензирование максимум через 3 дня с момента отправки, а процесс рецензирования рецензентом максимум через 5 дней с последующей доработкой/публикацией через 2 дня. Если статья получает уведомление о пересмотре от редактора, занимающегося рецензированием, то потребуется еще 5 дней для внешнего рецензирования предыдущим рецензентом или альтернативным рецензентом.

Принятие рукописей полностью обусловлено рассмотрением соображений редакционной группы и независимым рецензированием, что обеспечивает соблюдение самых высоких стандартов независимо от пути к регулярной рецензируемой публикации или быстрого процесса редакционного рецензирования. Обрабатывающий редактор и автор статьи несут ответственность за соблюдение научных стандартов. Плата за рассмотрение статьи в размере 99 долларов США не будет возмещена, даже если статья будет отклонена или отозвана для публикации.

Соответствующий автор или учреждение/организация несут ответственность за оплату FEE-Review Process. Дополнительный платеж FEE-Review Process покрывает быструю обработку рецензирования и быстрые редакционные решения, а регулярная публикация статьи включает подготовку в различных форматах для онлайн-публикации, обеспечение полнотекстового включения в ряд постоянных архивов, таких как HTML, XML и PDF, и подачу в различные индексирующие агентства.

Политика отзыва статей

Если автор запрашивает отзыв в течение 6 дней с момента подачи, автору разрешается отозвать рукопись без уплаты комиссии за отзыв, однако, если авторы отзывают рукопись в любое время после процесса рецензирования и принятия, комиссия за отзыв, т. е. 50 % от сбора за публикацию, должна быть уплачена в соответствии с правилом гонорара.

Подача статьи

Чтобы сократить задержки, авторы должны гарантировать, что уровень, объем и формат представленной рукописи соответствуют требованиям Лонг издательской СЛ на этапе подачи и каждой редакции. Представленные статьи должны иметь отдельное от основного текста резюме/аннотацию объемом до 300 слов. Это краткое описание не включает ссылки, числа, сокращения или измерения, за исключением случаев, когда это необходимо. Резюме должно содержать базовое введение в область; краткое изложение предыстории и принципа работы; изложение основных выводов; и 2-3 предложения, которые помещают основные выводы в общий контекст. Текст может содержать несколько коротких подзаголовков не более 40 символов каждый.

Форматы для Лонгдом издательская СЛ Вклады: Лонгдом издательская СЛ принимает следующие материалы: оригинальные статьи, обзоры, рефераты, приложения, объявления, комментарии к статьям, рецензии на книги, быстрые сообщения, письма в редакцию, тезисы ежегодных собраний, материалы конференций, календари, отчеты о случаях, исправления, обсуждения, отчеты о собраниях, новости, некрологи, речи, обзоры продуктов, гипотезы и анализы.

Все наши журналы находятся в открытом доступе. Каждая статья, опубликованная Лонгдом издательская SL, имеет определенный формат.

Категории статей

  • Оригинальные статьи: отчеты о данных оригинального исследования.
  • Рецензии: исчерпывающие, авторитетные описания любой темы в рамках журнала. Эти статьи обычно пишут специалисты в данной области, приглашенные редакционной коллегией.
  • Отчеты о клинических случаях: отчеты о клинических случаях, которые могут быть образовательными, описывать диагностическую или терапевтическую дилемму, предлагать связь или представлять важную побочную реакцию. Авторы должны четко описать клиническую значимость или значение случая. Во всех статьях с описанием болезни должно быть указано, что информированное согласие на публикацию информации было получено от пациентов или их опекунов.

  • Комментарии: короткие, целенаправленные, авторские статьи на любую тему в рамках журнала. Эти статьи обычно связаны с современными проблемами, такими как недавние результаты исследований, и часто пишутся лидерами общественного мнения.
  • Статьи по методологии: представляют новый экспериментальный метод, тест или процедуру. Описанный метод может быть новым или может предлагать лучшую версию существующего метода.
  • Письмо в редакцию: оно может принимать три формы: подробный повторный анализ ранее опубликованной статьи; существенный ответ на такой повторный анализ от авторов оригинальной публикации; или статья, которая может не охватывать «стандартное исследование», но может иметь отношение к читателям.

Для получения более подробной информации о каждом типе статей, пожалуйста, свяжитесь с редактором по электронной почте рукописи@longdom.org .

Подача рукописи

Один из авторов статьи, который берет на себя ответственность за статью во время подачи и рецензирования, должен следовать инструкциям по подаче и представить рукопись. Обратите внимание, что для обеспечения быстрой публикации и минимизации административных расходов Лонгдом издательская SL принимает только онлайн-заявки, и что за обработку всех принятых рукописей взимается плата за обработку статьи.

Во время подачи вас попросят предоставить сопроводительное письмо, в котором вы должны объяснить, почему ваша рукопись должна быть опубликована в журнале, и заявить о любых потенциальных конкурирующих интересах. Пожалуйста, предоставьте контактные данные (имя и адреса электронной почты) двух потенциальных рецензентов вашей рукописи. Это должны быть специалисты своего дела, которые смогут дать объективную оценку рукописи. Предлагаемые рецензенты не должны были публиковаться ни с одним из авторов рукописи в течение последних пяти лет, не должны быть текущими сотрудниками и не должны быть членами одного и того же исследовательского учреждения. Предложенные рецензенты будут рассматриваться вместе с потенциальными рецензентами, рекомендованными членами редколлегии.

Ниже приведен список допустимых форматов файлов. Дополнительные файлы любого типа, такие как фильмы, анимация или исходные файлы данных, также могут быть представлены как часть рукописи.

Вот файлы, необходимые для отправки:

  • Титульный лист
    Форматы: DOC
    Должен быть отдельным файлом, не встроенным в основную рукопись.
  • Основная рукопись
    Формат: DOC
    Таблицы объемом менее 2 страниц каждая (около 90 строк) должны быть включены в конец рукописи.
  • Форматы рисунков
    : JPG, JPEG, PNG, PPT, DOC, DOCX
    Рисунки должны быть отправлены отдельно, не встраиваясь в основную рукопись.
  • Сопроводительное письмо
    Форматы: DOC
    Должен быть отдельным файлом, не встроенным в основную рукопись.

Титульный лист должен:

  • укажите название статьи
  • перечислите полные имена, институциональные адреса и адреса электронной почты для всех авторов
  • указать соответствующего автора

Благодарности, источники финансирования и раскрытие информации

  • Благодарности: В разделе благодарностей перечислены существенные вклады каждого человека. Авторы должны получить письменное, подписанное разрешение от всех лиц, перечисленных в разделе «Благодарности» рукописи, поскольку читатели могут сделать вывод, что они согласны с данными и выводами. Эти разрешения должны быть предоставлены редакции.
  • Источники финансирования : Авторы должны перечислить все источники исследовательской поддержки, имеющие отношение к рукописи. Все аббревиатуры или акронимы организаций, финансирующих гранты, должны быть полностью расшифрованы.
  • Конфликт интересов: Авторы должны указать любые раскрытия информации в сопроводительном письме при подаче рукописи. Если конфликта интересов нет, укажите «Конфликт интересов: нет, о чем необходимо сообщить». Конфликты интересов связаны с отношениями с фармацевтическими компаниями, производителями биомедицинских устройств или другими корпорациями, чьи продукты или услуги связаны с предметом статьи. Такие отношения включают, помимо прочего, трудоустройство в промышленном концерне, владение акциями, членство в постоянном консультативном совете или комитете, членство в совете директоров или общественную ассоциацию с компанией или ее продуктами. Другие области реального или предполагаемого конфликта интересов могут включать получение гонораров или вознаграждения за консультационные услуги или получение грантов или средств от таких корпораций или отдельных лиц, представляющих такие корпорации.

Таблицы и рисунки

Каждая таблица должна быть пронумерована и цитирована по порядку с использованием арабских цифр (например, таблица 1, 2, 3 и т. д.). Заголовки таблиц должны располагаться над таблицей и содержать не более 15 слов. Они должны быть вставлены в конец текстового файла документа в формате A4 Книжная или Альбомная. Они будут набраны и отображены как таковые в окончательной опубликованной форме статьи. Таблицы должны быть отформатированы с использованием «Табличного объекта» в программе обработки текстов, чтобы гарантировать, что столбцы данных останутся выровненными, когда файл будет отправлен на проверку в электронном виде. Таблицы не должны быть встроены в виде рисунков или файлов электронных таблиц. Большие наборы данных или таблицы, слишком широкие для альбомной страницы, можно загружать отдельно в виде дополнительных файлов. Дополнительные файлы не будут отображаться в окончательном макете PDF статьи,

Рисунки должны быть предоставлены в отдельном файле .DOC, .PDF или .PPT с разрешением не менее 300 dpi и не встраиваться в основной файл рукописи. Если рисунок состоит из отдельных частей, отправьте одну составную страницу иллюстрации, которая включает все части рисунка. Плата за использование цветных рисунков не взимается. Подписи к рисункам должны быть включены в основной текстовый файл рукописи в конце документа, а не как часть файла рисунка. Для каждого рисунка должна быть предоставлена ​​следующая информация: нумерация рисунков по порядку, с использованием арабских цифр, заголовок не более 15 слов и подробная легенда до 300 слов. Обратите внимание, что автор(ы) обязаны получить разрешение от правообладателя(ов) на воспроизведение рисунков или таблиц, которые ранее были опубликованы в другом месте.

Рекомендации

Все ссылки, включая ссылки, должны быть пронумерованы последовательно, в квадратных скобках, в том порядке, в котором они цитируются в тексте, и должны быть оформлены в стиле Национальной медицинской библиотеки . Каждая ссылка должна иметь индивидуальный номер ссылки. Пожалуйста, избегайте чрезмерных ссылок. Можно цитировать только те статьи, наборы данных и рефераты, которые были опубликованы, находятся в печати или доступны через общедоступные серверы электронной печати/препринтов. Автор несет ответственность за получение разрешения цитировать личные сообщения и неопубликованные данные от цитируемых коллег. Аббревиатуры журналов должны соответствовать индексу Medicus/MEDLINE.

Цитаты в списке литературы должны включать всех названных авторов, вплоть до первых 6, перед добавлением « и др.». . Любой в прессестатьи, цитируемые в списках литературы и необходимые для рецензирующей оценки рукописи, должны быть доступны по запросу редакции.

Стиль и язык

Лонгдом издательская SL принимает только рукописи, написанные на английском языке. Правописание должно быть либо американским английским, либо британским английским, но не смесью.

Лонгдом издательская SL не будет редактировать язык представленных рукописей; таким образом, рецензенты могут посоветовать отклонить рукопись из-за грамматических ошибок. Авторам рекомендуется писать ясно и просто, а перед отправкой статьи проверять ее коллеги. Внутреннее редактирование будет минимальным. Те, для кого английский язык не является родным, могут воспользоваться нашими услугами копирайтинга. Пожалуйста, свяжитесь с  рукописями@longdom.org для получения дополнительной информации. Аббревиатуры должны использоваться как можно реже и должны быть определены при первом использовании.

Кроме того,

  • Пожалуйста, используйте двойной межстрочный интервал.
  • Используйте поля по ширине, без переноса слов на разрывы строк.
  • Используйте жесткий возврат только для завершения заголовков и абзацев, а не для перестановки строк.
  • Используйте только первое слово и имена собственные в названии с заглавной буквы.
  • Пронумеруйте все страницы.
  • Используйте правильный формат ссылки.
  • Отформатируйте текст в один столбец.
  • Могут быть включены греческие и другие специальные символы. Если вы не можете воспроизвести определенный символ, введите его название полностью. Пожалуйста, убедитесь, что в текст встроены все специальные символы; в противном случае они будут потеряны при преобразовании PDF.
  • Везде следует использовать единицы СИ (разрешены «литр» и «моль»).

Количество слов

Для оригинальных статей, статей по методологии и обзоров не существует явных ограничений на объем представляемых статей, но авторам рекомендуется быть краткими. Комментарии и истории болезни должны содержать от 800 до 1500 слов. Письма в редакцию должны быть от 1000 до 3000 слов. Также нет ограничений на количество рисунков, таблиц, дополнительных файлов или ссылок, которые могут быть включены. Рисунки и таблицы должны быть пронумерованы в порядке ссылок на них в тексте. Авторы должны включать все соответствующие вспомогательные данные в каждую статью.

Резюме оригинальных и методологических статей не должно превышать 250 слов и должно быть структурировано по разделам «Предпосылки», «Методы», «Результаты» и «Выводы». Для обзоров, пожалуйста, предоставьте неструктурированное краткое изложение из одного абзаца не более 350 слов основных поднятых вопросов. Для комментариев и историй болезни предоставьте краткое, неструктурированное резюме из одного абзаца не более 150 слов. Для писем в редакцию, пожалуйста, предоставьте краткое, неструктурированное резюме из одного абзаца не более 250 слов.

Пожалуйста, сведите к минимуму использование сокращений и не цитируйте ссылки в аннотации. Пожалуйста, укажите регистрационный номер вашей пробной версии после реферата, если это применимо.

Добавьте список из 3-10 ключевых слов под аннотацией.

Номера доступа нуклеиновой кислоты, белковых последовательностей или атомных координат, указанных в рукописи, должны быть указаны в квадратных скобках и включать соответствующее имя базы данных.

Процесс первоначального рассмотрения

Представленные рукописи будут первоначально оцениваться главным редактором и заместителем редактора. Быстрое первоначальное решение относительно того, следует ли официально рецензировать рукопись двумя или более рецензентами с соответствующим опытом или отклонять ее без формального рецензирования, будет определяться на основе качества, научной строгости и представления/анализа данных рукописи. Ожидается, что примерно 70 % представленных рукописей пройдут официальное рецензирование, а 30 % будут отклонены без оценки внешними рецензентами.

Инструкции для пересмотренных материалов

  • Предоставьте копию исправленного текста с отмеченными в тексте изменениями с помощью отслеживания изменений или выделения.
  • В своем письменном ответе на комментарии рецензентов укажите номер(а) страницы(ей), абзаца(ов) и/или номера строки, где была сделана каждая редакция.
  • Отвечайте на комментарии каждого рецензента, точно указывая изменения, внесенные в ответ на критические замечания. Кроме того, укажите причины предложенных изменений, которые не были реализованы, и укажите любые дополнительные изменения, которые были сделаны.
  • Изменения, не полученные в течение 2 месяцев, будут отозваны в административном порядке. Для дальнейшего рассмотрения рукопись должна быть повторно представлена ​​de novo. По усмотрению редакции и в тех случаях, когда требуются существенные новые данные, для внесения изменений может быть предоставлено продление. В таких случаях будут предприняты все усилия, чтобы сохранить первоначальных рецензентов.

Доказательства и перепечатки

Электронные доказательства будут отправлены в виде вложения по электронной почте соответствующему автору в виде файла PDF. Постраничные верстки считаются окончательным вариантом рукописи, и никакие изменения в рукопись на этапе верстки вноситься не будут. Авторы могут свободно скачать PDF-файл. Печатные копии документов предоставляются по запросу. Пожалуйста, нажмите на ссылку для оплаты.

Авторские права

Являясь членом Международной ассоциации издателей, PILA, Журнал протеомики и биоинформатики следует лицензии Creative Commons Attribution License и политике публикации открытого доступа ученых.

Все работы, опубликованные в Журнал протеомики и биоинформатики, находятся под лицензией Creative Commons Attribution License. Это позволяет любому копировать, распространять, передавать и адаптировать произведение при условии надлежащего цитирования оригинального произведения и источника.

Top