Журнал сельскохозяйственных наук и пищевых исследований
Открытый доступ

Абстрактный

AP-MS и рост органов у растений: от клеток к тканям

Герт Де Йегер

В основе структуры и емкости клеток лежат системы краткосрочного и долгосрочного субатомного сотрудничества. Исследовательская группа создателя создает интерактомные инструменты для растений и управляет лучшей в своем классе стадией масс-спектрометрии с аффинной очисткой (AP-MS) для разъединения белковых комплексов. Благодаря своей высокой специфичности и наглядной силе наш фонд последовательно превратился в центральный омиксный инструмент в нашем экзаменационном офисе. Здания были разделены для многих белков, связанных с развитием клеток и контролем размножения, что привело к раскрытию белков, практическому исследованию белковых структур и картированию белковых систем, связанных с развитием органов растений. Они начинались в клеточных сообществах, но последовательно продвигались к рассаде Arabidopsis, чтобы в конечном итоге оказаться в сельскохозяйственных культурах. Их большие органы делают их особенно разумными для исследования ошеломляющего руководства по развитию органов в формирующей обстановке. Они получили доказательства идеи для исследования элементов белкового комплекса во время развития листьев и показывают его использование для проектирования развития органов.

Поскольку для всех намерений и целей все белки взаимодействуют с различными белками, рассмотрение белок-белковых ассоциаций (PPI) имеет решающее значение для понимания работы белков. Это особенно очевидно при рассмотрении явных формирующих процедур, в которых белки часто создают формирующие стадии или явные взаимодействия тканей. Как бы то ни было, рассмотрение этих конкретных PPI in planta может быть тестированием. Одной из наиболее общепринятых стратегий для изучения PPI in planta является очистка нежности в сочетании с масс-спектрометрией (AP/MS). Текущие достижения в области масс-спектрометрии помогли использованию AP/MS в формирующих условиях. Этот обзор охватывает два основных прогресса в области санитарной обработки склонности для рассмотрения формирующих процедур растений: расширение формирующих целей собранных тканей и переход от очистки нежности к улучшению частичности. Кроме того, мы говорим о некоторых новых подходах к очистке частичности, которые появились в последнее время и могут глубоко повлиять на конечную судьбу исследования белкового интерактома в растениях.

Хлоропласты и митохондрии жизненно важны для развития растений. Они не только дают клеткам жизненную силу и источники углерода, но и развились, чтобы стать важными игроками в ряде процедур, например, расщеплении аминокислот, биосинтезе гормонов и маркировке клеток. Как полусамоуправляемые органеллы, они содержат небольшой геном, который в значительной степени зависит от атомных компонентов для его поддержания и артикуляции. Концентрированное перекрестное взаимодействие между ядром и органеллами впоследствии является основополагающим для обеспечения надлежащей работы, а атомные качества, кодирующие органелларные белки, участвующие в фотосинтезе и окислительном фосфорилировании, явно критически важны для развития растений. Развитие органов контролируется двумя основными формами клеток: размножением клеток и расширением клеток. Здесь мы изучаем, как развитие растений зависит от особенностей органелларных белков, которые по-разному сообщаются во время развития листьев и корней. Наши открытия демонстрируют разумную роль органелларных белков в развитии органов растений, в основном во время размножения клеток. Как бы то ни было, до этого момента работа атомно-кодируемых органеллярных белков в клеточных формах, управляющих развитием органов, не была исследована достаточно подробно. Поэтому мы призываем специалистов расширить свое фенотипическое изображение за пределы явно видимых моментов, чтобы продемонстрировать признаки улучшения того, как хлоропласты и митохондрии управляют фундаментальными процедурами размножения клеток и развития клеток, что является основой для управления развитием.

В момент создания растений размножение клеток и развитие клеток жестко контролируются, чтобы производить органы с определенным конечным размером, например, листья. Несколько исследований показали важность стадии расширения клеток для развития листьев, представляя, что руководство клеточного цикла является обязательным для правильного продвижения листьев. Огромное и сложное расположение ассоциированных белков, которые составляют интерактом клеточного цикла, контролирует изменение, начиная с одной стадии клеточного цикла, а затем на следующую. Здесь мы рассматриваем существующую информацию о контроллерах клеточного цикла из этого интерактома, влияющих на последний размер листа, когда их внешний вид регулируется, в основном у Arabidopsis. Несмотря на описание уродств CYCLIN-DEPENDENT KINAS (CDK), CYCLINS (CYC) и их транскрипционных и посттрансляционных контроллеров, представлено фенотипическое исследование уродств добавления и потери работы для 27 качеств, кодирующих белки, которые взаимодействуют с белками клеточного цикла. Эта совокупность данных показывает, что когда качества, связанные с клеточным циклом, неправильно передаются, развитие листьев регулярно изменяется и что, по-видимому, три фундаментальных паттерна имеют все признаки того, что они являются жизненно важными в руководстве по окончательному размеру органа по качествам, связанным с клеточным циклом: (I) оплата клеток; (ii) измерение качества; и (iii) правильный прогресс через стадию G2/M путем включения ANAPHASE PROMOTING COMPLEX/CYCLOSOME (APC/C). В целом, это мета-исследование показывает, что интерактом клеточного цикла улучшается в контроллерах развития листьев и представляет возможность отличить новые контроллеры развития листьев среди предполагаемых новых контроллеров клеточного цикла.