Журнал физической химии и биофизики
Открытый доступ

Абстрактный

Комплексный сравнительный анализ морфологических изменений в 12-мерном ДНК-олигонуклеотиде при платинировании цисплатином, оксалиплатином и BNP3029 (аналог платины на основе замещенного цианолиганда) с использованием исследований с использованием моделирования молекулярной динамики

Паванкумар ПНВ, Аяла П.Ю., Паркер А.Р., Чжао М., Джаир К., Чен Икс, Кочат Х. и Хаушир Ф.Х.

Цисплатин является важным противораковым средством, широко используемым в клинике; однако у него есть несколько заметных ограничений. Для разработки новых аналогов платины были рассмотрены ключевые характеристики, которые могут привести к более эффективным аналогам платины. В этом исследовании мы представляем комплексные исследования моделирования молекулярной динамики с использованием 12-мерного ДНК (5'-CCTCTggTCTCC-3', gg = место платинирования) олигонуклеотида, который был платинирован цисплатином (1), оксалиплатином_1R_2R (2) и BNP3029 (3, новый замещенный цианоплатиновый аналог, PtCl2[N≡C(CH2)3(C6H5)]2), и проанализировали большой объем выходных данных с использованием статистического анализа Колмогорова-Смирнова. Подводя итог, данные показали, что BNP3029-ДНК имела менее А-подобную морфологию ДНК по сравнению с цисплатин-ДНК и оксалиплатин-ДНК, таким образом сохраняя более В-подобную форму ДНК. BNP3029 продемонстрировал более мощную цитотоксическую активность по сравнению с цисплатином и оксалиплатином в различных линиях раковых клеток человека, включая несколько линий клеток, устойчивых к платине.