Передовые методы в биологии и медицине
Открытый доступ

Абстрактный

Консервированные антипептиды широкого спектра действия против ВИЧ — надежда на лечение ВИЧ

Баладжи С. Рао, Кришна Кант Гупта, Сучитра Кумари, Анкит Гупта и К. Пуджита

Антипептид или ингибирующий пептид направлен на предотвращение взаимодействия вируса и корецептора. В этом исследовании использовался набор данных по ингибирующим ВИЧ пептидам, собранный из базы данных HIPdb. В базе данных HIPdb присутствует 110 ингибирующих ВИЧ пептидов. Было проведено множественное выравнивание последовательностей (MSA) всех 110 антипептидов и получены некоторые наиболее консервативные антипептиды. Затем был использован метод прогнозирования антигенности для нахождения максимальной антигенности из 14 консервативных ингибирующих пептидов. Все пептиды были проверены на гидрофобность, поскольку низкая гидрофобность вызывает гуморальный опосредованный иммунитет. После этого было проведено прогнозирование антимикробных пептидов (AMP) и их классификация. В этом исследовании PWQGGRRKFR и KYRRFRWKFK являются перспективными антипептидами ВИЧ для лечения СПИДа. Это исследование поможет ученым продвигать исследования для лучшего понимания лечения ВИЧ в формах разработки лекарств и вакцин.