Журнал садоводства

Журнал садоводства
Открытый доступ

ISSN: 2376-0354

Абстрактный

Пересечение финишной черты: как разработать диагностические ДНК-тесты в качестве селекционных инструментов после открытия QTL

Вандерзанде С., Пьясковски Дж. Л., Луо Ф., Эдж-Гарза ДА., Клипфель Дж., Шаллер А., Мартин С. и Пис К.*

ДНК-информированная селекция, интеграция генетической информации на основе ДНК в программы селекции растений, может повысить эффективность, точность, креативность и темпы разработки новых сортов. Большая часть генетических знаний о ключевых признаках для селекции растений была получена с помощью анализа QTL. Несмотря на взрывной рост открытий QTL для садовых культур, очень немногие из этих открытий были преобразованы в инструменты для селекции садовых культур. Примером таких инструментов с прямым применением в генетическом улучшении культур являются ДНК-тесты с предсказанием признаков. Перевод перспективного QTL в «ДНК-тест» с предсказанием признаков состоит из пяти шагов: (1) выбор целевого QTL; (2) разработка анализа для целевого локуса; (3) анализ особей; (4) отслеживание наследования; и (5) распространение подробностей ДНК-теста. Ключевой информацией, которую следует донести до конечных пользователей о ДНК-тесте, являются рассматриваемая культура и признак(ы), целевой локус или локусы признака и используемый тип маркера; наследуемость признака и генотипическая дисперсия, объясняемые ДНК-тестом; эффекты аллелей, частоты и распределения зародышевой плазмы; и технические детали для проведения теста. В этой статье приведены инструкции по переводу перспективных QTL в удобные для селекционеров, предсказывающие признаки ДНК-тесты, основанные на нашем опыте с древесными плодами. Наша цель — ускорить разработку предсказывающих признаки ДНК-тестов и установить стандартную структуру для их представления. Поскольку научное понимание генетических факторов, контролирующих селекционно-релевантные признаки, продолжает расширяться, систематическая и усиленная разработка ДНК-тестов должна помочь преодолеть пропасть между академическими исследованиями и селекционным применением.

Отказ от ответственности: Этот тезис был переведен с использованием инструментов искусственного интеллекта и еще не прошел рецензирование или проверку.
Top