Журнал физической химии и биофизики
Открытый доступ

Абстрактный

Кристаллическая структура Escherichia coli GroEL в субстратном и АДФ незагруженном состоянии

Ситарам Мина и Аджай К. Саксена

E. coli GroEL является членом семейства АТФ-зависимых шаперонинов и участвует в правильном сворачивании цитозольных бактериальных белков. E. coli GroEL содержит 14 идентичных субъединиц ~58,3 кДа и организован в виде двух колец с ножками. В текущем исследовании мы определили рентгеновскую структуру E. coli GroEL с разрешением 3,2 Å. Белок GroEL был коэкспрессирован во время экспрессии рекомбинантного белка M. tuberculosis DprE1 в E. coli и был совместно очищен с DprE1. Комплекс GroEL-DprE1 был кристаллизован, и анализ рентгеновской структуры дал электронную плотность только для белка GroEL и отсутствие плотности для белка DrpE1. Сравнение нашей структуры GroEL с предыдущими структурами дикого типа GroEL (PDB-1XCK), DM-GroEL-(ATP)14 (PDB-1KP8) и GroEL- GroES-(ADP)7 (PDB-1PF9) выявило различия в (i) взаимодействиях между гептамерными кольцами, участвующими в аллостерической сигнализации (ii) взаимодействиях внутри гептамерного кольца, (iii) спиралях H и I апикального домена, участвующих в связывании субстрата, и (iv) остатках, участвующих в сигнальном пути. Эти результаты указывают на то, что наша структура GroEL может находиться в другом состоянии, которое возникало во время цикла сворачивания белка после выгрузки субстрата и АДФ.