Достижения в области генной инженерии

Достижения в области генной инженерии
Открытый доступ

ISSN: 2169-0111

Абстрактный

Разработка и анализ ансамблевого классификатора для данных по экспрессии генов рака

Nianfeng Song, Kun Wang, Menglu Xu, Xiaolu Xie, Gan Chen and Ying Wang

Уровни экспрессии генов важны для таких заболеваний, как диагностика рака. В этой статье предлагается ансамблевый классификатор на основе SVM для классификации контрольных и онкологических групп на основе уровней экспрессии генов из данных микрочипов. Комбинированное рекурсивное исключение признаков в сочетании с алгоритмом Adaboost было разработано для выбора значимых признаков и проектирования надлежащего классификатора. Метод применяется к данным микрочипов онкологических пациентов, и результаты показывают улучшение показателей успешности. Согласно расчету AUC, ансамблевый классификатор на основе SVM показывает преобладающую производительность. Кроме того, обсуждаются характеристики и различные проблемы влияния на производительность классификации. Если один SVM может получить удовлетворительную производительность классификации, ансамблевый SVM вряд ли способен ее улучшить. В противном случае ансамбль SVM превосходит лучший одиночный SVM. Мы также исследовали влияние функций ядра, выбора признаков и типа классификаторов на классификацию.

Отказ от ответственности: Этот тезис был переведен с использованием инструментов искусственного интеллекта и еще не прошел рецензирование или проверку.
Top