Транскриптомика: открытый доступ
Открытый доступ

Абстрактный

Дифференциальный анализ кДНК, входящей в состав микробных матов

Раджарши Патнаик

Незапятнанные микробные маты из солеварен Камарга (Франция), поддерживаемые в микрокосме, были загрязнены топливом Эрика, чтобы распознать качественные механизмы, приводимые в действие в соответствии со значительным загрязнением топливом. Подход дифференциальной демонстрации был скорректирован для распознавания дифференциально сообщающейся мРНК в сложных бактериальных сетях. Среди шести отделенных дифференциально сообщающихся (DD) фрагментов кДНК один был выделен и связан с сифоном оттока типа ABC. Последующий DD-участок был идентифицирован с умеренным спекулятивным белком, обнаруженным в широком спектре видов бактерий. Несмотря на то, что дифференциально сообщающиеся фрагменты оказались неспособными быть явно распознанными, это исследование раскрывает новые точки зрения для улучшения нашего понимания реакции микробной сети после заражения нефтью. Микробы считаются основными биотическими персонажами на экране при порче нефтяных товаров в природе. Поскольку один вид бактерий может разлагать ограниченное количество углеводородов, биодеградация нефти in situ обычно выполняется консорциумом, состоящим из многочисленных видов бактерий. Различные переменные могут влиять на прочность структуры бактериальной сети, которая включает бактериальное соперничество, профаги и физические/концентрационное условия. В прибрежных зонах, особенно подверженных незапланированным разливам нефти и другим ненадлежащим практикам, микробные маты образуются на границе раздела вода-муть. Естественное развитие этих бактериальных структур и их обширный кластер микробных упражнений свидетельствуют о том, что они могут быть ценными для биоремедиации экологических загрязнений.