Журнал лекарственного метаболизма и токсикологии
Открытый доступ

Абстрактный

Влияние молекулярной структуры, субстрата и оценок стыковки на прогнозирование констант ингибирования ингибиторов P-гликопротеина

Мохсен Шарифи, Алексей В. Раевский и Тарават Гафурян

P-гликопротеин (P-gp) — это многоспецифичный транспортер, который играет естественную роль детоксикации. Ингибирование транспорта субстрата P-gp может быть представлено рядом параметров, включая процентное ингибирование и IC50. Константа ингибирования, Ki, считается более универсальным параметром, позволяющим легко сравнивать данные из различных условий субстрата. Целью данного исследования было использование молекулярных дескрипторов ингибиторов, оценок стыковки и параметров субстрата зонда для разработки количественных соотношений структура-активность (QSAR) для прогнозирования констант ингибирования P-gp. QSAR были разработаны с использованием ряда методов добычи данных и выбора признаков предварительной обработки. Дерево регрессии на основе хи-квадрат, за которым следовала модель усиленных деревьев, были наиболее точными в оценке Ki. Выбранные модели включали молекулярные дескрипторы ингибиторов, за которыми следовали молекулярные дескрипторы субстратов зонда, тогда как оценки стыковки не были выбраны моделями. Мощные ингибиторы P-gp показали более высокую липофильность и молекулярную массу, чем молекулы, определенные правилом Опреа.