Журнал медицинских методов диагностики
Открытый доступ

Абстрактный

Эффективность различных стратегий ген-мишеней для скрининга SARS-CoV-2 с помощью ОТ-ПЦР и других методов: обзорный обзор

Дипджьоти Калита*, Сангита Дека

Предыстория: Продолжающаяся пандемия коронавируса 2019 года (COVID-19) привела к тому, что молекулярная диагностика, особенно методы полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР в реальном времени), стала чрезвычайно зависимой для диагностических целей. Сложная исследовательская/диагностическая техника практически трансформировалась в методику тестирования в месте оказания помощи. Со временем происходит эволюция различных типов генных мишеней.

Цель: составить связный обзор литературы по эффективности и точности различных генных мишеней для различных протоколов/наборов ОТ-ПЦР для обнаружения тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса 2 (SARS-CoV-2). Мы также хотим проанализировать другие развивающиеся методы и радиологические методы, например, сканирование с помощью компьютерной томографии (КТ) для диагностики COVID 19.

Материалы и методы: Был проведен поиск литературы по молекулярным методам и целям диагностики COVID-19 в Medline, Google Scholar, Embase, на серверах препринтов (например, bioRxiv).

Результаты: Из первоначальных 33 статей/отчетов было сохранено семь оригинальных статей. Наиболее часто используемыми генными мишенями были E-ген, RdRp, ORF 1b, S, N и т. д. Испытываются многочисленные новые протоколы полимеразной цепной реакции (ПЦР) с новыми мишенями. Развиваются и другие молекулярные методы обнаружения. Радиологическое исследование (например, КТ грудной клетки) оказалось очень полезным, особенно в случаях с высоким подозрением на ОТ-ПЦР-отрицательные случаи.

Заключение: Почти все наборы ОТ-ПЦР следуют рекомендациям Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) по двум целям. Радиология (КТ) определенно играет роль в диагностике COVID.