Журнал противовирусных и антиретровирусных препаратов
Открытый доступ

Абстрактный

Анализ in silico штаммов вируса гепатита В генотипа Е у пациентов из Центральной Африки, не получавших лечения, выявил важные мутации в полном геноме

Жискар Вильфрид Койаведа, Розалин Мачария, Жюльетт Роуз Онгус, Юнис Мачука, Роджер Пелле, Нарцисс Патрис Комас*

Предыстория: Вирус гепатита B (HBV) остается серьезной проблемой здравоохранения, несмотря на принимаемые в настоящее время меры профилактики и лечения. Данных о молекулярной характеристике штаммов, циркулирующих в Центральноафриканской Республике (ЦАР), мало. Здесь мы секвенировали полноразмерный геном HBV, выделенный от пациентов с ЦАР.

Методология: Образцы сыворотки были собраны в Институте Пастера в Банги. Полноразмерный вирусный геном был выделен и секвенирован с использованием метода Сэнгера с четырьмя перекрывающимися праймерами. Последовательности были проанализированы in silico на предмет мутаций и устойчивости к лекарствам с использованием инструментов биоинформатики.

Результаты: Четыре полноразмерных генома HBV были успешно секвенированы. Все четыре изолята принадлежали к генотипу E и содержали мутацию rtI90L в функциональном домене A обратной транскриптазы (RT). Один изолят содержал бессмысленную мутацию на 3'-конце S-ORF, что приводило к преждевременному стоп-кодону и образованию коротких белковых последовательностей для всех трех поверхностных белков (большой, средний и малый поверхностные антигены). Анализ in silico показал, что этот же мутантный изолят также нес мутацию rtH234N в функциональном домене RT D, что увеличивает энергию связывания и приводит к снижению сродства к адефовиру и тенофовиру.

Выводы: Генотип E вируса гепатита B является основным генотипом, циркулирующим в CAR. Мы выявили мутацию в гене RT штамма CAR HBV, и эта мутация может быть связана с лекарственной устойчивостью. Поэтому необходимо дальнейшее углубленное исследование RT HBV в штаммах HBV, циркулирующих в CAR.