Разработка лекарств: открытый доступ
Открытый доступ

Абстрактный

Исследования in silico для проектирования и разработки ингибитора против COVID-19

Акшата Р. Пахелкар, Притам В. Багве, Кхушбу Маурья, Нихил Р. Пахелкар, Шриранг В. Джоши, Викас Н. Телвекар

Цель: пандемия COVID-19, объявленная ВОЗ, сообщила о первом случае в Ухане, провинция Хуней, Китай. Инфекции в настоящее время широко распространены, и по состоянию на 30 марта 2020 ^года во всем мире было зарегистрировано 693224 случая заражения и 33106 смертей. Это международная проблема, связанная с общественным здравоохранением. Несколько исследований проводятся по всему миру в условиях кризиса. Изучаются различные гипотезы лечения и профилактики, касающиеся разработки вакцин, повторного использования лекарств и разработки новых химических веществ. COVID-19 — это вирус из семейства коронавирусов вирусов рода бета. Он имеет сходство с SARS-CoV, о котором сообщалось ранее. Мы планируем предложить основу для разработки пептидного специфического ингибитора против COVID-19.

Методы: Наша стратегия включает в себя разработку пептидного ингибитора, который будет взаимодействовать с RBM SARS-CoV-2 и препятствовать его проникновению внутрь клетки. Компьютерное проектирование лекарств является одним из доступных инструментов, которые могут помочь в достижении производительности за более короткий промежуток времени. Мы использовали онлайн-платформу для проектирования пептидов под названием rosetta, программное обеспечение для автоматизированного проектирования лекарств Autodock Vena (лицензировано г-ном Нихилом Пахелкаром) и Schrodinger's Drug Discovery Suite (лицензировано ICT, Мумбаи).

Результат: Мы предлагаем пептид на основе последовательности человеческого ACE2, который сильно взаимодействует с RBM SARS-CoV-2. Заинтересованные читатели могут использовать последовательность для дальнейшей модификации последовательности пептида, чтобы превратить ее в пептидомиметик.