Журнал медицинских методов диагностики
Открытый доступ

Абстрактный

Оценка целостности выделенной РНК с помощью референтного материала РНК

Джунко Такахаси, Акико Такацу и Хитоши Ивахаси

Физиологическая информация, которая идентифицирована по уровню экспрессии РНК в тканях или органах, дает нам преимущество в клинической диагностике. После извлечения РНК из крови, ткани или органов диагностика проводилась с использованием техники полуколичественной оценки конкретной мРНК, такой как ПЦР в реальном времени или ДНК-микрочипы. Проверка качества РНК требует количественной оценки экспрессии генов на момент взятия пробы, поскольку использование деградированной РНК приведет к неверным результатам. В этом исследовании мы провели серию экспериментов для оценки целостности РНК с использованием референтных материалов длиной РНК 1000 пар оснований (refRNA1000) и сравнили с RIN. Существует значительная корреляция между RIN и количеством refRNA1000 в разном состоянии деградации. Существуют также значимые корреляции между количеством refRNA1000 и эндогенным геном, таким как Actb и Rps18 в разном состоянии деградации в нашем исследовании. Количество эндогенного гена отражает степень деградации более непосредственно, чем количество RIN. Чтобы контролировать степень деградации от экспериментальной начальной точки, мы можем обратиться к референтным материалам refRNA1000. Не только для клинической диагностики, но ученые всегда требуют обоснованности экспериментальной процедуры, одним из методов-кандидатов является использование референтных материалов РНК, таких как refRNA1000