Журнал физической химии и биофизики
Открытый доступ

Абстрактный

Формирование и взаимодействие ярких солитонов с изменением формы в модели ДНК

Конрад Бертран Таби

Я исследую столкновение локализованных структур, возникающих из общих начальных решений в модели Пейрарда-Бишопа. С помощью полудискретного приближения показано, что амплитуды волн описываются дискретным нелинейным уравнением Шредингера. Соответствующие солитонные решения этого уравнения получены с помощью метода билинеаризации Хироты. Эти решения включают как одно-, так и двухсолитонные решения. Особое внимание уделяется поведению, демонстрируемому двухсолитонным решением. Принимая один из солитонов за насос, а другой за пузырь, который описывает локальное раскрытие двух нитей ДНК, я показываю, что усиление пузырьков происходит из-за передачи энергии от насоса к пузырьку в процессе столкновения. Также показано, что базовые солитоны подвергаются захватывающему изменению формы (перераспределению интенсивности) при столкновении.