Транскриптомика: открытый доступ
Открытый доступ

Абстрактный

Генетическое разнообразие огурцов с использованием межпростых повторов последовательностей (ISSR)

Сингх Д.К., Раджани Тевари, Сингх Н.К. и Шашанк С. Сингх

Огурец — важная овощная культура, выращиваемая во всем мире. Генетическое разнообразие и сходство между 11 генотипами огурца, а именно: PCUCP-2, PCUCP-3, Nun-3139, Nun-3121, Nun-3141, Infinity, Isatis и Kian, а также PCUC-8, PCUC-15 и PCUC-28, выращивались в тепличных условиях в Университете сельского хозяйства и технологий имени ГБ Панта в Пантнагаре. Свежие и молодые листья были собраны с каждого генотипа. Листья были разрезаны на мелкие кусочки и измельчены в порошок с использованием жидкого азота. Затем геномная ДНК была выделена с использованием модифицированного метода CTAB. Генетическое разнообразие и сходство были оценены с использованием 8 маркеров ISSR. 6 праймеров ISSR сгенерировали в общей сложности 49 полиморфных аллелей. На основе данных ISSR дендрограмма сгруппировала генотипы в два основных кластера и пять подкластеров. Среди всех генотипов наблюдался в общей сложности 40-100% полиморфизма. Количество аллелей, продуцируемых различными праймерами, варьировалось от 5 до 14 со средним значением 9,5 аллелей на праймер, а уровень полиморфизма составил 88,88%. Значение сходства варьировалось от 35% до 96%. Три моносомных генотипа, а именно PCUC-8, PCUC-15 и PCUC-28 (Pant Khira-1), были сгруппированы в один кластер с 96% сходства, тогда как партенокарпические генотипы в другом кластере. Поэтому делается вывод, что характеристика и определение разнообразия среди партенокарпических и моносомных огурцов выполнены, эта информация может быть использована для разработки эффективной программы селекции огурцов.