Иммунные исследования
Открытый доступ

Абстрактный

Генетическая регуляция гельсолина в легких у мышей и его потенциальный широкий спектр биологических функций

Сяоюнь Лю, Хелин Фэн, Цзяцянь Чжу, Рэйчел Стейн, Юэ Хуан, Ян Цзяо и Сяодун Чжу

Были проведены значительные исследования потенциальной биологической функции гельзолина и его связи с иммунной системой человека, заболеваниями и другими расстройствами. Целью нашего исследования было выявление генетических факторов, которые регулируют гельзолин в легких мышей, и анализ его функции иммунной системы с использованием четко определенных рекомбинантных инбредных штаммов. Для этой цели мы выбрали рекомбинантные инбредные (RI) штаммы BXD, полученные из потомства штаммов-предшественников C57BL/6J (B6) и DBA/2J (D2). Для картирования eQTL использовалась экспрессия генов всего генома в легких. Для анализа генов-кандидатов использовались инструменты биоинформатики и данные генотипирования. Для оценки связи между гельзолином и биологическими признаками использовались процессы генной сети и корреляции. Данные показали, что eQTL на хромосоме 9, охватывающий геномную область между 21 Мб и 30 Мб, играет важную роль в регуляции уровня экспрессии гельзолина. Анализ генетических элементов в этом регионе показал, что Ncapd3 является наиболее предпочтительным геном-кандидатом. Его уровень экспрессии тесно связан с уровнем гельзолина. Уровень экспрессии гельзолина между штаммами мышей с двумя генотипами SNP (rs13480109) в регуляторной области Ncapd3 показал значительную разницу. Дополнительный анализ ассоциации предполагает, что гельзолин может иметь широкий спектр биологической функции. Уровень экспрессии гельзолина имеет очень высокую корреляцию с генами в различных биологических функциях. Эти высоко ассоциированные гены в основном предназначены для связывания белков. Экспрессия гельзолина также коррелирует с несколькими известными иммунными фенотипами. Эти данные вносят значительный вклад в наши текущие знания о биологической функции гельзолина.