Волчанка: открытый доступ
Открытый доступ

Абстрактный

Генетическая вариация в локусе ДНКазы I в австралийской когорте пациентов с СКВ

Одри А. Марджери-Мьюир, Джон Д. Уэзеролл и Дэвид М. Грот

Цель: Концентрации и активность ДНК-SE I в сыворотке, а также мутации последовательности были вовлечены в патологию системной красной волчанки (СКВ). Это исследование было проведено для оценки концентраций ДНК-SE I в сыворотке и оценки вариации последовательности ДНК-SE I в когорте пациентов с СКВ и контрольной группы.

Методы: Концентрации ДНКАЗЫ I в сыворотке были исследованы у 56 пациентов с СКВ и 33 контрольных лиц соответствующего возраста и пола. Все пациенты с СКВ и контрольные лица были генотипированы на экзомные аллели в локусе ДНКАЗЫ I и на аллели переменного числа тандемных повторов, присутствующих в интроне 4 (VNTR - HumDN1).

Результаты: Наблюдались перекошенные распределения концентрации белка DNASE I, при этом среднее значение для пациентов с СКВ составило 44,2 Ед/мл по сравнению с 56,4 Ед/мл в контрольной группе (NS). Ни один образец не дал отрицательного результата на белок DNASE I. Были идентифицированы только два из ранее зарегистрированных шести экзомных аллелей (DNASE*1, DNASE*2) вместе с четырьмя аллелями VNTR (три-шесть повторов). Оба локуса продемонстрировали равновесие Харди-Вайнберга. Наблюдалось неравновесное сцепление между экзомными аллелями и аллелями VNTR, особенно между DNASE I* и аллелем VNTR с 4 повторами (HumDN1). Не наблюдалось значимых ассоциаций между концентрациями DNASE I и генотипами. Оценки частот гаплотипов показали схожие распределения как для СКВ, так и для контрольных когорт, хотя было отмечено, что гаплотипы, содержащие DNASE*2, имели повышенную частоту более длинных аллелей VNTR, чем DNASE*1.

Мета-исследование экзомных аллельных частот ДНКSE I показало схожие частоты с полученными в других популяциях. Для локуса VNTR более длинные аллели (пять и шесть повторов) встречались чаще, хотя разницы между пациентами с СКВ и контрольной группой не было.

Заключение: Это исследование не подтверждает гипотезу о том, что определенные генотипы ДНКазы I из двух локусов предрасполагают к СКВ в когорте жителей Западной Австралии.