Достижения в области генной инженерии
Открытый доступ
ISSN: 2169-0111
ISSN: 2169-0111
Тахерех Алинежад
В этом исследовании влияние температуры воды и экологических переменных на невосприимчивое качество артикуляции у пресноводной креветки (Macrobrachium rosenbergii) оценивалось по пятнадцати основным качествам устойчивости. Качество было выбрано и спланировано нашим предыдущим исследованием транскриптомной информации и протеома M.rosenbergii. Лабораторный тест на воздействие различных температур, представленных пресноводным креветкам, был применен к местной среде обитания ранчо пресноводных креветок. Для исследования были выбраны два различных ранчо в соответствии со стандартом и нестандартной практикой управления и оборудования. Набор тестов был организован в разное время суток при различных температурах воды от 24 °C до 32 °C. Связь качества климата неуязвимого каркаса пресноводной креветки к тепловому оглушению и каркасов доски была сконцентрирована путем применения профилирования дифференциального качества артикуляции (Fluidigm Biomark HD) в трех уникальных органах: сыворотке, гепатопанкреасе и мышцах. Результаты подтвердили, что повышение температуры воды напрямую влияет на невосприимчивые реакции пресноводных креветок. Аналогичным образом, влияние различной температуры воды на качественное сочленение в сыворотке, гепатопанкреасе и мышцах пресноводных креветок было дополнительно изучено с помощью дифференциального качественного исследования сочленения. Корреляция качественной информации о сочленении трех групп показала, что неуязвимые пути, кодирующие качества, в основном контролируются вниз, а метаболитные кодирующие качества в основном контролируются вверх по сравнению с повышением температуры. Наше исследование обнаружило новую качественную ассоциацию в лектиновом пути, который является тахилектином, как еще одним потенциальным конкурирующим качеством для продвижения естественных маркеров давления у пресноводных креветок. Это исследование также дало существенные данные о дифференциальном сочленении нового безопасного пути монстра, следующего за естественным давлением, что поможет улучшить понимание качественных климатических ассоциаций у этого вида, используя 15 качеств, которые были запланированы из транскриптомной информации, полученной в предыдущем исследовании. Кроме того, экологическое обследование ранчо дало важные данные о влиянии содержания грязи и воды, корма для креветок и методов ведения фермерского хозяйства на улучшение качества неуязвимых пресноводных креветок и урожайности ранчо.
В последнее время появились высокопроизводительные инновации, например, секвенирование с передовой технологией (NGS), которые широко используются как в геномных, так и в транскриптомных исследованиях. Инновации NGS также могут использоваться для изучения артикуляции различного качества в различных тканях или определенных условиях, например, стрессе и загрязнении микроорганизмами, а также в модельных и немодельных формах жизни. Существуют транскриптомные чтения для креветок-пенеид, например, Peneaus monodon, Litopeneaus vannamei, Fenneropeneaus chinensis, Fenneropenaeus merguiensis и Marsupeneaus japonicus, для исследования явной артикуляции тканей, реакции давления и вирусных заболеваний. Также были проведены многочисленные исследования по полному транскриптомному секвенированию гепатопанкреаса M. rosenbergii из-за заражения Vibrio parahaemolyticus, гепатопанкреаса и лимфоидного органа в свете инфекции расстройства белых пятен (WSSV) и кишечной ткани в свете WSSV или вирусной копии PAMP (поли I:C). Совсем недавно было рассмотрено транскриптомное исследование кроветворной ткани взрослой креветки M. rosenbergii в свете заболевания MrNV. Было получено значительное количество дифференциально обильных записей с различными безопасными инструментами, например, рецепторами распознавания дизайна, средствами профилактики рака и антимикробными пептидами
Чтобы дифференцированно различить записи о вознаграждении, связанные с загрязнением MrNV, мы провели секвенирование РНК на шести воссозданных образцах каждого твердого PL и предварительно зараженного MrNV PL. Результаты показали, что 5538 записей были дифференцированно связаны, при этом 2413 записей были направлены вверх, а 3125 записей были направлены вниз. Среди этих записей часть из них была связана с естественной безопасной структурой из-за вирусного заболевания.
Чтобы одобрить наши результаты сбора и дифференцированного богатства, мы также выбрали 9 фокусов для одобрения с помощью qPCR и продемонстрировали низкий уровень ложного раскрытия в этих качествах. Мы просеяли наш список DEG, как указано в утилитарных собраниях значимости, включая белки распознавания дизайна (PRP) и противовирусный белок, структуру профенолоксидазы (ProPO), сигнальные пути Toll-IMD, антимикробные пептиды (AMP) и структуру свертывания крови, фагоцитоз и апоптоз, структуру противораковых агентов и импеданс РНК (RNAi). Различные исследования показали высокую взаимосвязь между данными РНКсек и qPCR. Кроме того, исследования РНКсек M. rosenbergii из-за бактериального и вирусного заражения также продемонстрировали высокую взаимосвязь между результатами РНКсек и qPCR. Чтобы повысить нашу уверенность, мы одобрили эти результаты в свободных органических примерах. Загустевание крови является гуморальной реакцией, которая предупреждает повреждение гемолимфы и распространение микробов во время травмы. У мусорщика свертывание крови включает перекрестное соединение общего количества загустевающих белков (CP) кальций-подчиненной трансглутаминазой (TGase), доставляемой гемоцитом. Прошлые исследования показали, что сочленение лизоцима и крустина у M. japonicus было подавлено у креветок с истощенной TGase, что свидетельствует о наличии связи между структурой загустевания крови и AMP. Мы обнаружили, что сочленение трансглутаминазы и гемицентин-1-подобной изоформы X2 (HMCN1) было повышено. Аналогичным образом, мы одобрили утверждение HMCN1, которое было повышено на 5,31-сгиб в РНК-сек и 16,07-перекрытием с помощью qPCR. Эти результаты показали, что эти две части свертывания крови включены в качестве реакции на загрязнение MrNV. Кроме того, повышение уровня двух компонентов свертывания крови, лизоцима и некоторых изоформ крустина, может продемонстрировать связь между структурой сгущения крови и АМП у M. rosenbergii.