Достижения в области генной инженерии
Открытый доступ

Абстрактный

Геномика 2019: Транскриптомный анализ бородавок, вызванных ВПЧ, и здоровой кожи у людей: поисковое исследование

Laith N. Al-Eitan

Известные как причина появления родинок у людей, вирусы папилломы человека (ВПЧ) представляют собой непреодолимое скопление ДНК-инфекций, которые передаются между людьми посредством контакта кожа-к-коже. Из-за того, что родинки встречаются у 7-12% населения, заражение ВПЧ является, как правило, обычным заболеванием, которое поражает примерно 1 из каждых 10 человек в течение жизни. После широкого аудита всех текстов было обнаружено, что ни в одной статье не изучались качественные профили артикуляции родинок, вызванных ВПЧ. Основной целью этого исследования является определение того, есть ли различие в качественных профилях артикуляции родинок и здоровой кожи у людей с ВПЧ+. Инновация в секвенировании РНК была использована Джорданом беспрецедентно, чтобы определить, есть ли различие в качестве артикуляции между родинками, вызванными ВПЧ, и здоровой кожей. Корреляции между родинками, вызванными ВПЧ, и плотной кожей у арабских пациентов Иордании были завершены с использованием структуры секвенирования Illumina HiSeq 2500. Различные биоинформатические программы использовались для измерения дифференциальной артикуляции, исследования улучшения набора качества, исследования пути и группировки тепловой карты. Было обнаружено, что родинки, вызванные ВПЧ, имеют чрезвычайно большой и исключительный наследственный знак. Значительное количество направленных вверх качеств были идентифицированы со злокачественностью и инфекцией (WIF1, HMGCS2, CLU и PTGIS), в то время как несколько направленных вниз качеств были связаны с помехами качества (SPINK6, PI3, SERPINB4, SERPINB3). Кроме того, было обнаружено, что лучшие 500 дифференциально сообщаемых качеств связаны с невосприимчивыми и иммунными путями системы, например, дегрануляция нейтрофилов, путь рецептора стоимости 7/8 (TLR 7/8), путь рецептора стоимости 9 (TLR9) и путь рецептора стоимости 10 (TLR10) и другие. Родинки, вызванные ВПЧ, имеют безошибочный дизайн артикуляции качества, который отделяет их от здоровой кожи, но разделяет много общего с другими заболеваниями кожи. Будущие направления исследований должны изучить качества, представляющие интерес, выявленные в этом исследовании, индивидуально, чтобы выяснить степень их патогенности.

Вирус папилломы человека (ВПЧ) — это ДНК-инфекция, которая связана с многочисленными заболеваниями и является причиной практически всех случаев злокачественных новообразований шейки матки. Описано около 200 видов ВПЧ, и эти виды называются высокоопасными или в целом безопасными в зависимости от их способности вызывать разрушительные или щедрые повреждения по отдельности. 4,5% новых случаев заболевания в целом вызваны заражением высокоопасным ВПЧ, однако в целом безопасные виды обычно проявляются в виде родинок. Обыкновенные родинки (Verruca vulgaris) являются наиболее распространенным видом родинок, составляя 70% всех негенитальных кожных родинок, и считаются по своей природе безобидными.

Кожа человека состоит из двух слоев, эпидермиса и дермы, и ВПЧ фокусируется только на самом нижнем слое эпидермиса, базальном слое, чтобы создать стойкое заболевание, после чего он захватывает меру разделения кератиноцитов с конечной целью полезного жизненного цикла вируса. Соответственно, наука о ВПЧ различается в базальных и супрабазальных кератиноцитах, последние из которых связаны с различными фазами эпителиального разделения. Кератиноциты составляют 90% каждой отдельной эпидермальной клетки, и проблемы с их разделением делают кожу более уязвимой для заражения и болезней. В настоящее время не существует лекарства от самого ВПЧ, и его лечение сосредоточено вокруг облегчения клинических симптомов до тех пор, пока заболевание не будет нормально очищено невосприимчивой структурой. Тем не менее, нет убедительных доказательств относительно того, полностью ли инфекция удалена из организма или по сути сведена к незаметным уровням.

Хотя много исследований было посвящено наследственным качествам злокачественных новообразований, связанных с ВПЧ, существует дефицит данных относительно наследственной основы негенитальных кожных родинок, что показывает насущную необходимость более легкого понимания их этиологии. Следовательно, цель текущего исследования заключается в том, чтобы дать геномную корреляцию транскриптомов основных родинок и обычной кожи с использованием новейшего секвенирования.

Текущее исследование послужило для объяснения наследственной основы заражения ВПЧ в отношении негенитальных кожных родинок. Открытия текущего исследования показали нарушение регуляции различных качеств, которые могут играть основную роль в развитии родинок, включая KRT16, EPGN, C15orf59, CYB561A3 и FCGRT. Кроме того, было обнаружено несколько невосприимчивых путей, связанных с каркасом, которые связаны с выдающимися качествами DE, включая дегрануляцию нейтрофилов, фактор разделения миелоидных клеток 88 и рецепторы, подобные стоимости.

Наши данные также предполагают, что несколько качеств, связанных с неуязвимой реакцией, могут играть основную роль в поощрении меры заражения ВПЧ. Фактически, исследование неуязвимой клеточной сигнатуры продемонстрировало отличительные уровни движения многочисленных клеток, связанных с резистентной структурой, включая клетки NKT, DC и Treg. Значительная часть качеств, обнаруженных для участия в подобных родинках, не была предметом прошлых исследований, оцененных друзьями, что рекомендует будущие рубрики и направления исследований, сосредоточенные на этих индивидуальных качествах, а также на примерах артикуляции отдельных типов ВПЧ.