Журнал гликомики и липидомики
Открытый доступ

Абстрактный

Glycomics становится визуальным и интерактивным

Алессандра Гастальделло

Glycomics@ExPASy вкладка «Гликомика» на сервере Швейцарского института биоинформатики (www.expasy.org/glycomics) была создана в 2016 году для централизации веб-ресурсов по гликоинформатике, разработанных в рамках международной сети гликоученых. Философия этого набора инструментов заключается в том, чтобы быть {гликоученым И ученым по белкам}???дружественным с целью популяризации (a) использования биоинформатики в гликобиологии и (b) связи между гликобиологией и ресурсами биоинформатики, ориентированными на белки. Нехватка связующих данных привела нас к разработке инструментов, максимально интерактивных на основе подключения к базам данных, чтобы облегчить исследование данных и поддержать построение гипотез. Текущий набор ресурсов в основном построен на основе курируемых или экспериментальных данных относительно структур гликанов, гликопротеинов, взаимодействий хозяин-патоген и данных масс-спектрометрии. Информация предоставляется пользователю с помощью специальных сервисов, встроенных в веб-приложения. Инструменты запросов поддерживают запросы по составу, подструктуре, эпитопам для сопоставления структур и связанных функций. В этой презентации будет рассмотрен последний выпуск Glycomics@ExPASy и основное внимание будет уделено недавно разработанным инструментам, большинство из которых являются визуальными и интерактивными.