Анестезия и клинические исследования
Открытый доступ
ISSN: 2155-6148
ISSN: 2155-6148
Хосе Мануэль Перес-Агилар, Джеффри Г. Савен и Рэнью Лю
Модели человеческого μ-опиоидного рецептора были построены с использованием структур рецепторов, сопряженных с G-белком (GPCR), и методов гомологического (сравнительного) моделирования. Недавняя публикация кристаллической структуры высокого разрешения конструкции на основе мышиного μ-опиоидного рецептора предлагает уникальную возможность оценить надежность моделей гомологии и проверить уместность введения большего количества шаблонов (известных структур) для повышения точности сравнительных моделей. В первой модели использовались два шаблона: β2 - адренергические и бычьи родопсиновые рецепторы. Для второй модели использовались четыре шаблона: β2 - адренергические, бычьи родопсиновые, β1 - адренергические и A2A - аденозиновые рецепторы. Включение дополнительных шаблонов улучшило точность структурных мотивов и других характеристик модели при использовании того же выравнивания последовательностей. Предсказанные структуры были особенно актуальны в важных областях рецепторов, таких как мотив DRY, который был связан с активацией рецептора. Кроме того, это исследование показало, что сходство последовательностей рецепторов имеет решающее значение в моделировании гомологии, как указано в случае весьма разнообразной петли EC2. Это исследование демонстрирует надежность метода моделирования гомологии в случае μ-опиоидного рецептора, члена класса GPCR семейства родопсин-подобных. Добавление большего количества шаблонов повысило точность модели. Результаты, касающиеся моделирования, имеют существенное значение для других GPCR, где кристаллическая структура все еще неизвестна, и предполагают, что методы моделирования гомологии могут предоставить высококачественные структурные модели для интерпретации экспериментальных результатов и формулирования структурно обоснованных гипотез относительно активности этих важных рецепторов.