Журнал клинических испытаний
Открытый доступ

Абстрактный

Идентификация и анализ молекулярных путей и ключевых потенциальных биомаркеров при мультиформной глиобластоме

Адити Стути Кумари

Мультиформная глиобластома (GBM) — злокачественная первичная опухоль IV степени, присутствующая в центральной нервной системе. Несмотря на достижения в лечении, прогноз неблагоприятный, поскольку медиана выживаемости составляет 14–15 месяцев. Целью данного исследования было выявление потенциальных биомаркеров, а также функциональных путей, регулируемых в GBM. Полученный набор данных (GSE100675) включал 3 ткани глиобластомы, 3 парные ткани и 3 нормальные ткани. Дифференциально экспрессируемые гены (DEG) были идентифицированы с помощью GEO2R, ​​который обнаружил в общей сложности 1609 DEG (916 с пониженной регуляцией и 693 с повышенной регуляцией). С DEG были выполнены онтология генов и анализ путей KEGG. Затем анализ путей KEGG использовался для построения сети взаимодействия белков (PPI) с целью выявления интересующих генов. Затем сеть взаимодействия была помещена в цитоскейп, и было идентифицировано 10 генов-концентраторов. Для обеспечения надежности исследования эти гены-хабы были помещены в GEPIA, и данные были сравнены на предмет согласованности исследования, при этом регуляция всех 10 генов-хабов соответствовала регуляции более крупного набора данных. Анализ Каплана-Майера был проведен на генах-хабах, который показал, что повышенная регуляция в сигнальном преобразователе и активаторе транскрипции 3 (STAT3) была связана с более низкой выживаемостью. Исследование показывает, что ген STAT3 может быть ключевым фактором в прогрессировании GBM, играя решающую роль в пролиферации клеток. В заключение, STAT3, наряду с идентифицированными молекулярными путями, может использоваться в качестве потенциального прогностического и диагностического биомаркера и может быть использован для дальнейшего изучения GBM.