ISSN: 2168-9784
Ким Х., Бредель М., Пак Х., Чуанг Дж.Х.
Проект Cancer Genome Atlas (TCGA) сделал доступными несколько гетерогенных наборов данных. Хотя было предложено несколько методологических подходов для интеграции гетерогенных данных, не существует структуры разреженной неотрицательной матричной факторизации (NMF) для обработки гетерогенной интеграции биологических данных. Здесь мы предлагаем блочно-взвешенную разреженную NMF (bwsNMF) для идентификации подтипов опухолей эндометриальной карциномы путем интеграции экспрессии генов, мутаций, сети белок-белкового взаимодействия и целевой сети транскрипционных факторов.