Иммунные исследования
Открытый доступ

Абстрактный

Иммуноинформационный подход — разработка вакцины на основе множественных пептидов из гликопротеина E вируса простого герпеса 3-го типа

Сахар Оби Абд Альбаги, Сафаа Хаг Ахмед, Тана Эльджозоли Мохамме, Эсамелдин Ахмед Адам и Мохаммед Хасан

Предыстория: Вирус простого герпеса (ВПГ) является распространенным человеческим патогеном, вызывающим инфекции слизистых оболочек ротовой полости (ВПГ-1) и слизистых оболочек половых органов (ВПГ-2). Продуктивная инфекция приводит к образованию везикулярных поражений в эпителии слизистой оболочки с последующим распространением вируса на сенсорные нейроны и установлением латентной инфекции, которая может сохраняться в течение всей жизни хозяина.
Материал и метод: Все последовательности гликопротеина E [вирус герпеса человека 3] были получены из NCBI, и эти последовательности были подвергнуты прогнозируемым инструментам IEDB, включая исследование В-клеток и Т-клеток, при этом В-клетки прошли несколько тестов, таких как прогнозирование эпитопов, доступность поверхности и прогнозирование антигенности; Т-клетки включали прогнозируемые инструменты MHC I и MHC II. Наконец, мы использовали охват популяции, чтобы выбрать самый высокий процент пептидов, связанных с различными аллелями.
Результат: Мы получили несколько пептидов-кандидатов в качестве вакцинных пептидов из теста B-клеток, которые имели наивысший балл в поверхностной доступности Эмини («DEDKLDTNSVYEPYYHSDHAESSWVNRGESSRKAYDHNSPYIWPRNDYDGF»), равный 21,807, и «LKFVDTPESL» с баллом 1,061 для теста антигенности Коласкара и Тонгаонкара, с другой стороны, мы получили наивысшее сродство пептидов, которые взаимодействовали с основным покрытием различных аллелей в MHC I («KAYDHNSPY») и в MHC II («MWNYHSHVF»).
Заключение: Необходимо оценить эффективность и степень безопасности в предсказанных эпитопах-кандидатах с помощью методов вычислительной экспертизы с помощью исследований на животных моделях, чтобы проверить, способны ли они вызывать хороший защитный иммунный ответ или нет с ранее упомянутыми свойствами, и мы рассматривали это исследование как первую многообещающую вакцину на основе пептидов гликопротеина E [вируса герпеса человека 3] по сравнению с предыдущими исследованиями.