Передовые методы в биологии и медицине
Открытый доступ

Абстрактный

Исследование маркеров резистентности к артемизинину в выбранные интервалы в течение 72-часового периода после применения комбинированной терапии на основе артемизинина в Кисуму, Западная Кения

Аполло Асенат, Лорна Дж. Чебон, Кенет Митей, Бенджамин Опот, Деннис В. Джума, Эндрю Ньерере, Бен Андагалу, Осия М. Акала и Мэтью Л. Браун

Предыстория: Микроскопическое обнаружение паразитов во время курса лечения или последующего наблюдения предполагает, что у части детей, прошедших лечение АКТ в Кении, не происходит полного избавления от паразитемии Plasmodium falciparum. Мутация Plasmodium falciparum в гене-транспортере устойчивости к хлорохину (Pfcrt76), гене множественной лекарственной устойчивости 1 (Pfmdr1), гене деубиквитинирующего фермента (Pfcubp-1) и гене, кодирующем субъединицу u, ассоциированную с клатриновыми везикулами, и гене, кодирующем белок множественной лекарственной устойчивости 1 (Pfmrp1), была связана с последующим рецидивом после лечения АКТ. Поскольку на сегодняшний день в Африке нет подтвержденных маркеров устойчивости к АКТ, наблюдение за изменениями этих полиморфизмов во время курса лечения полезно для установления их роли в результатах лечения АКТ. Методы: 118 образцов P. falciparum 2013–2015 годов из исследований клинической эффективности ACT были генотипированы на предмет частоты полиморфизмов лекарственной устойчивости с использованием анализаторов последовательностей. Каждый образец был проверен по крайней мере в трех-четырех временных точках, а именно: нулевой день до начала лечения, затем 2-й и 3-й дни после начала лечения, а также день последующей паразитемии с помощью микроскопии до 42-го дня для некоторых субъектов. Анализаторы последовательностей использовались для генотипирования на предмет частоты полиморфизмов лекарственной устойчивости, количества копий гена Pfmdr1 и генетического разнообразия типирования 12 микросателлитных локусов. Генетическое разнообразие популяций паразитов в четырех временных точках определялось путем анализа 12 микросателлитных локусов. Для определения показателей очищения от паразитов использовался оценщик очищения от паразитов (PCE) Всемирной сети по борьбе с малярией. Результаты: Новые гены Pfap2mu и Pfubp имели S145C и E1528D, являющиеся наиболее полиморфными с распространенностью 18% и 19% соответственно. Pfmdr1 86,184 и 1246 имели значительное увеличение аллелей дикого типа между нулевым днем ​​и временными точками 3 и 4. Анализ профиля микросателлитов показывает, что среднее число аллелей во всех локусах в 8 популяциях варьировалось от 9,250 до 1,000. Поли α был наиболее полиморфным с 35 аллелями. Средний несмещенный HE составил 0,672, в то время как индекс разнообразия Шеннона для 8 популяций варьировался от 0,182 до 0,000, ни один из проанализированных паразитов не имел соответствующих гаплотипов. Средний период полувыведения паразитов составил 2,63 ч (95% доверительный интервал [ДИ]), а медианный период полувыведения составил 2,24 ч. Период полувыведения паразитов варьировался от 1,14 до 5,05 ч. Заключение: увеличение дикого типа Pfmdr1 86,184 и 1246, а также полиморфизмы в Pfap2mu и Pfcubp-1 в посленулевой день предполагают, что эти гены могут реагировать на дозировку АКТ и, следовательно, требуют постоянного мониторинга. Образцы с несколькими копиями Pfmdr1 не показали никакого эффекта на скорость выведения паразитов. Хотя не было никакой корреляции между этими профилями и скоростью выведения,Необходимы дальнейшие оценки для определения потенциальных последствий этих наблюдений для общественного здравоохранения и полезности этих локусов в качестве маркеров чувствительности к артемизинину в популяциях P. falciparum во всем мире.