Журнал медицинских методов диагностики
Открытый доступ

Абстрактный

Масс-спектрометрия MALDI-TOF как инструмент для анализа эпидемиологических вспышек. Может ли она работать?

Муттерс Н.Т., Буркхардт И. и Хиг К.

Предыстория: Матрично-ассистированная лазерная десорбционная ионизация-времяпролетная масс-спектрометрия (MALDI-TOF) обеспечивает быструю и точную идентификацию микроорганизмов. В нескольких отчетах высказывались предположения о ее использовании в эпидемиологическом типировании. Однако нет систематического сравнения со стандартными методами типирования, такими как гель-электрофорез в импульсном поле (PFGE). В этом исследовании оценивается потенциальное использование MALDI-TOF для анализа предполагаемых вспышек ванкомицин-резистентных энтерококков (VRE) по сравнению с PFGE.

Методы: Во время предполагаемой вспышки VRE, включая пять пациентов, в отделении интенсивной терапии, все изоляты были проанализированы с помощью PFGE, а также MALDI-TOF. Была создана серия из 24 спектров для каждого извлеченного изолята. Полученные спектры были сглажены, скорректированы по базовой линии и откалиброваны. Затем были созданы основные спектры (MSP) с использованием масс-спектрометра Microflex (Bruker-Daltonik) и MALDI Biotyper 3.0. Массовые пики сравнивались вручную; дендрограмма была автоматически сгенерирована. Все изоляты были протестированы в трех повторностях для оценки колебаний измерений.

Результаты: Анализ пиков массы MSP и дендрограммы позволил четко идентифицировать три различных штамма, которые согласуются с PFGE. Были четко идентифицированы два кластера, отражающие четыре изолята и две произошедшие передачи. Колебания измерений не повлияли на типирование штамма.

Выводы: MALDI-TOF предоставил результаты, соответствующие PFGE, и это за долю времени и затрат. Однако алгоритм Bruker для автоматизированного создания дендрограммы частично состоит из оценок журнала идентификации, что делает его разрешение слишком низким для точного типирования. Следовательно, полностью автоматизированный анализ невозможен. Однако полученные результаты показывают некоторый потенциал для использования MALDI-TOF в качестве эпидемиологического инструмента для будущего управления вспышками.