ISSN: 2161-1068
Баканелли ГМ*, Араужо ФР, Вербиск НВ
Масс-спектрометрия с ионизацией и десорбцией матрицы с матрицей (MALDI-TOF MS) использовалась для идентификации Mycobacterium spp. из-за ее скорости, надежности, экономичности и высокой эффективности. Однако клеточная стенка микобактерий богата липидами, что затрудняет получение белков для анализа с помощью MALDI-TOF MS. В этом исследовании сравнивались два протокола экстракции белков: MycoEx, рекомендованный производителем инструмента MALDI-TOF Bruker Daltonics, и протокол MycoLyser, описанный здесь, в котором для разрыва клеток использовался инструмент MagNA Lyser. Экстракция белков с использованием двух протоколов проводилась с использованием вирулентного штамма M. tuberculosis H37Rv (NCBI NC_000962), и результаты сравнивались. Протокол MycoLyser позволил улучшить идентификацию M. tuberculosis с помощью Biotyper , поскольку полученные с помощью этого протокола баллы в основном составляли ˃1800. Точность идентификации составила 38,8% (A), 44,5% (B), 16,7% (C) для MycoLyser и 0% (A), 16,7% (B), 83,3% (C) для MycoEx. Ввиду этих результатов очевидно, что новый протокол MycoLyser для экстракции микобактериальных белков позволяет повысить эффективность метода MALDI-TOF MS для идентификации M. tuberculosis .