ISSN: 2161-0398
Салам Прадип Сингх, Читта Ранджан Деб, Лакхми Нандан Какати и Болин Кумар Конвар
Известно, что фермент фумараза катализирует стереоспецифическое взаимопревращение фумарата в L-малат, которое является частью цикла Кребса. Несмотря на биологическое значение и важность этого фермента, механизм реакции фумаразы не полностью понят или известен. В этом контексте был проведен эксперимент по моделированию молекулярной динамики в течение не менее 10 наносекунд с использованием программы Nano Scale Molecular Dynamics, реализованной в Discovery Studio 4.0. Траекторный анализ различных энергетических параметров выявил термодинамическую стабильность фермента. Полученные результаты могут помочь в понимании биологического значения этого фермента.