Журнал клинической и клеточной иммунологии
Открытый доступ

Абстрактный

Экспрессия генов, связей с митохондриями, и сигнатуры макрофагов при немелкоклеточном раке легких, в том числе у пациентов с эмфиземой как сопутствующим заболеванием

Нг Ки Квонг Ф., Николсон АГ, Павлидис С., Эдкок И.М. и Чунг К.Ф.

Цель: Наша цель — определить, является ли митохондриальная дисфункция причиной, способствующей повышению риска немелкоклеточного рака легких (НМРЛ) у пациентов с ХОБЛ.
Методы: Клиническая инновационность экспрессии генов, связей с митохондриями, при раке легких была определена с использованием транскриптомных данных более 1000 образцов НМРЛ человека. Затем иммуногистохимия использовалась для изучения специфической по типу клеточной экспрессии красного белка, связанного с митохондриями, в нормальной и раковой легочной ткани. Анализ вариаций набора генов (GSVA) ​​был применен к наборам данных НМРЛ для относительной корректировки экспрессии характерных транскриптомных сигнатур макрофагов.
Результаты: Экспрессия 33 генов, связанных с митохондриями, коррелировала с выживаемостью пациентов с НМРЛ. Кроме того, мы научили экспрессию PGAM5 и FUNDC1, которые являются регуляторами митохондриальной деградации (митофагии). В фоновой легочной ткани PGAM5 и FUNDC1 были выражены только в альвеолярных макрофагах, с наиболее высокой экспрессией у курильщиков с эмфиземой по сравнению со здоровыми курильщиками и некурящими. В раковой ткани только злокачественные эпителиальные клетки и связанные с ними макрофаги на периферии экспрессировали PGAM5 и FUNDC1. PGAM5 также экспрессировался в преднеопластических эпителиях (плоскоклеточная дисплазия и карцинома in situ). Не было никакой разницы в экспрессии в раковой ткани между отдельными эмфиземами, здоровыми курильщиками и некурящими. Макрофаги на краю рака у пациентов с эмфиземой имели место в более высокой экспрессии PGAM5 и FUNDC1 по сравнению с таковыми из других групп. Была выявлена ​​значимая корреляция между экспрессией PGAM5 в раковой ткани и 9 из 49 ранее известных транскриптомных сигнатур макрофагов, одна из которых (модуль 22) была обеспокоена выживаемостью пациента (p < 0,05).
Заключение: PGAM5 экспрессируется в предраковой ткани и НМРЛ, но не в нормальном эпителии. Связь между экспрессией PGAM5 и исходом рака легких может быть опосредована индукцией различных фенотипов макрофагов.