ISSN: 2169-0138
Юрий Н Воробьев
Разработка лекарственного соединения, которое может эффективно связываться с внутренней поверхностью канала E и блокировать диффузию ионов H + /K + через канал и ингибировать репликацию вируса, является важной задачей. Набор кандидатов на лекарственные средства, производных соединения-лидера (диазабициклооктана), был предложен ранее, и его взаимодействие с нативными и мутантными структурами белка E исследуется с помощью моделирования MD и моделирования положения/энергии связывания. Показано, что белок E имеет внутриканальные и внеканальные сайты связывания с высоким сродством к набору молекулярных блокаторов. Рассмотрены наиболее вероятные мутанты аминокислот канала E и проанализирована эффективность внутриканального связывания молекул-блокаторов.