Журнал медицинских методов диагностики
Открытый доступ

Абстрактный

Молекулярная характеристика комплекса Mycobacterium tuberculosis в регионе Гамбелла, юго-запад Эфиопии

Гулич Г.А., Тулу К.Т., Ворку А., Зевуде А. и Чимиди Г.А.

Предыстория: Информация о генетическом разнообразии Mycobacterium tuberculosis в определенном географическом регионе необходима для лучшего понимания эпидемиологии туберкулеза и может иметь значение для разработки новых диагностических средств, лекарств и вакцин. Целью данного исследования было предоставление информации о штаммах M. tuberculosis, циркулирующих в регионе Гамбелла.

Методы: Поперечное исследование проводилось в течение шести месяцев (ноябрь 2012 г. и апрель 2013 г.) с целью получения первичных данных о генетическом разнообразии Mycobacterium tuberculosis. Использовались клиническое обследование, окраска по Цилю-Нильсену, культивирование Mycobacterium и молекулярное типирование. Изоляты M. tuberculosis характеризовались с использованием области различия 9 (RD9) и сполиготипирования. Паттерны штаммов, идентифицированных сполиготипированием, сравнивались с паттернами, зарегистрированными в базе данных SpoIDB4 Института Пастера.

Результаты: Положительный результат культуры был подтвержден в 53,49% (46/86) случаев с положительным результатом мазка. После молекулярной характеристики 86,95% (40/46) образцов с положительным результатом культуры были M. tuberculosis. Сполиготипирование 40 изолятов привело к идентификации 24 паттернов сполиготипов. Семь паттернов были кластеризованы и состояли из 2-3 изолятов, в то время как остальные 17 паттернов были некластеризованы и состояли из одного изолята. Наиболее распространенным штаммом был сполиготипирование International Typing (SIT) 289 с долей 20,0% (8/40). Группировка изолятов в линии показала, что 32,50% (13/40) были евро-американскими, 17,50% (7/40) — индо-океаническими, и, что удивительно, оставшиеся 50,0% (20/40) изолятов не могли быть сгруппированы в уже известные линии и, следовательно, были
новыми.

Заключение: Результаты этого исследования показывают, что большинство штаммов M. tuberculosis, циркулирующих в регионе, отличаются от штаммов, зарегистрированных в других районах страны. Следовательно, программа по борьбе с туберкулезом должна уделять внимание контролю туберкулеза в регионе Гамбелла. Кроме того, характеристика штаммов M. tuberculosis, циркулирующих в регионе, сыграет большую роль в картировании молекулярной эпидемиологии туберкулеза в Эфиопии.