Разработка лекарств: открытый доступ
Открытый доступ

Абстрактный

Молекулярная стыковка синтезированных производных трипептидов с использованием WEBINA 1.0.3

Р. Говиндараджан1, Виссарапу Нага Лакшми2*

Метод in-silico занял позицию удивительной значимости в области открытия лекарств. Молекулярная стыковка — это вычислительный метод, широко используемый для неожиданного предсказания режимов связывания и сродства малых молекул к их целевым молекулам (обычно белкам). Молекулярная стыковка значительно облегчилась благодаря резкому росту вычислительной мощности и растущей доступности баз данных малых молекул и белков. Webina — это библиотека сборки JavaScript/веб, которая запускает Autodock Vina, популярное программное обеспечение для молекулярной стыковки, полностью в интернет-браузере. Расчеты стыковки происходят на собственном компьютере пользователя, а не на удаленном сервере. Веб-приложение Webina включает удобный интерфейс, поэтому пользователи могут без труда настраивать свои стыковочные запуски и анализировать эффекты. Доступ к рабочей модели приложения можно получить бесплатно. Всего было завершено 18 синтезированных производных пептидов для исследований молекулярной стыковки с белком 4FGW с использованием сетевого сервера Webina. A2, A3, B1, B2 и B3 показали хорошую активность.