Иммунные исследования

Иммунные исследования
Открытый доступ

ISSN: 1745-7580

Абстрактный

Длина пептида существенно влияет на сродство in vitro к молекулам MHC класса II

Катал О'Брайен, Даррен Р. Флауэр

Предыстория: Молекулы главного комплекса гистосовместимости (MHC) класса II имеют открытую связывающую бороздку, которая может вмещать пептиды различной длины. Несколько исследований продемонстрировали, что фланкирующие остатки пептидов (PFR), которые лежат за пределами основной связывающей бороздки, могут влиять на связывание пептидов и распознавание Т-клеток. Используя данные из базы данных AntiJen, мы смогли систематически охарактеризовать влияние PFR на сродство пептидов к молекулам MHC класса II. Результаты: Проанализировав 1279 событий удлинения пептидов, охватывающих 19 различных аллелей HLA, было отмечено, что в целом удлинение пептидов приводило к повышению сродства молекул MHC класса II. Также удалось определить оптимальную длину пептида для сродства MHC класса II, составляющую приблизительно 18–20 аминокислот; удлинение пептидов сверх этой длины приводило к нулевому или отрицательному эффекту на сродство. Заключение: Наблюдаемая взаимосвязь между длиной пептида и сродством к MHC II класса имеет важное значение для разработки вакцин и изучения эпитопической основы иммунологических заболеваний.

Отказ от ответственности: Этот тезис был переведен с использованием инструментов искусственного интеллекта и еще не прошел рецензирование или проверку.
Top