Журнал клинической и клеточной иммунологии
Открытый доступ

Абстрактный

Фактор плюрипотентности PBX1 предсказывает эффективность лечения ревматоидного артрита

Карин М.Е. Андерссон1 , Эрик Малмхалл-Бах1 , Нина Ю.Опарина1 , Вейян Тао1 , Аридаман Пандит2 , Малин К. Эрландссон1,3, Венкатарагаван Чандрасекаран1 , София Т. Сильфверсверд1 , Рилле Пуллеритс1,3,4, Мария И. Бокарева1,3*

Цель: Мы изучаем молекулярные механизмы, лежащие в основе восстановления Т-клеток при ревматоидном артрите (РА), задаваясь вопросом, может ли PBX1, фактор транскрипции, поддерживающий плюрипотентность стволовых клеток, предсказывать ответ на противоревматическое лечение.

Методы: Полногеномная транскриптомика путем секвенирования РНК была проведена в CD4 ⁺ T-клетках у 87 пациентов с РА с низкой и у 78 пациентов с РА с высокой активностью заболевания. Сравнивались результаты лечения в группах PBX1 ^hi и PBX1 ^lo . PBX1-ассоциированный фенотип и биологические процессы были идентифицированы путем кластеризации генов, дифференциально экспрессируемых в PBX1 ^hi CD4 ⁺ клетках. Кластеры PBX1 ^hi в тимусе были идентифицированы с помощью анализа на основе отдельных клеток. Транскрипционные мишени PBX1 среди DEG были предсказаны с помощью интегративного анализа мотива ДНК, секвенирования иммунопреципитации хроматина и данных открытого хроматина.

Результаты: клетки PBX1 ^hi CD4 ⁺ имели импринтированные черты плюрипотентности и не обладали продукцией цитокинов. При активном РА клетки PBX1 ^hi были обогащены предшественниками претимических лимфоцитов CD34 ^{+ . У пациентов с PBX1 hi} наблюдалось лучшее снижение DAS28 при лечении анти-ФНО и низкая частота неответчиков по сравнению с PBX1 ^lo (оба, p=0,026). При неактивном РА клетки PBX1 ^hi были обогащены посттимическими наивными Т-клетками, экспрессирующими CD62L/SELL и CD31/PECAM1. Здесь пациентам с PBX1 ^hi требовалось меньше лечения для достижения ремиссии по сравнению с пациентами с PBX1 ^{lo (p=0,011). В тимусе CD34 и PECAM1 были аннотированы в кластерах PBX1 hi} . Интегративный анализ показал, что центральные гены созревания Т-клеток TBX21, PRDM1, BATF3 и KLF1 транскрипционно зависят от PBX1.

Заключение: Это исследование показывает, что обогащение PBX1 связано с плюрипотентным фенотипом клеток CD4 ⁺ , что способствует улучшению ответа на лечение РА.