Чэнь-И Чанг1 , Су-сянь Цзэн2 , Юань-Дин Ма1 , Цзюнь-Вэнь Чжэн1 , Синь Ли1 , Чэнь-Юн Сюн1 , Хун-Цзинь Чжоу1 , Чун-Тао Вэй1 , Цзун-Цян Ли
Определить важные гены, которые влияют на фенотипические различия между свиньями пород Ландрас и Дебао, особенно различия в метаболизме и росте мышц. Дифференциально экспрессируемые гены большой поясничной мышцы были обнаружены с помощью секвенирования транскриптома мРНК у свиней пород Ландрас и Дебао. Извлекая общую РНК большой поясничной мышцы свиней пород Ландрас и Дебао, очищая мРНК, конструируя библиотеку кДНК, проводя секвенирование транскриптома, а затем с помощью оценки качества секвенирования, мы знаем, что качество секвенирования этого исследования относительно высокое. Всего во всех образцах было обнаружено 17 943 гена, включая 17 870 известных генов и 73 новых гена. Определены гены с |log2FC| больше 2 и значением Q меньше 0,001, и проверены как значительно дифференциально экспрессируемые гены. Всего было проверено 1661 дифференциально экспрессируемых генов из образцов свиней пород Ландрас и Дебао, среди которых 1255 генов были дифференциально активизированы, а 406 генов были дифференциально деактивизированы. С помощью дифференциального анализа генов сделан вывод, что эти гены в основном участвуют в регуляции метаболизма, развитии мышц и жира и других процессах, особенно некоторые важные функциональные гены, такие как MAPK14, FOS, SIRT1, KRAS, EGR1, CDNNB1 и т. д. Подводя итог, можно сказать, что в этом исследовании использовался метод секвенирования транскриптома, а затем были отобраны дифференциально экспрессируемые гены между свиньями пород Ландрас и Дебао с помощью анализа данных и, наконец, были отобраны важные гены, влияющие на фенотипические различия, что обеспечило генетическую поддержку для выведения лучших пород в будущем.