Достижения в педиатрических исследованиях
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ISSN: 2385-4529
ISSN: 2385-4529
Ruta Kulkarni, Atul M. Walimbe, Shobha D. Chitambar
Contexte : Les norovirus (NoV) sont la deuxième cause la plus fréquente de gastroentérite infantile sporadique dans le monde. Les NoV du génotype GII.4 sont prédominants à l'échelle mondiale et subissent une évolution continue dans le gène VP1, codant pour la principale protéine de capside, entraînant l'émergence de nouveaux variants, avec quatorze variants de GII.4 identifiés à ce jour. Méthodes : La présente étude a examiné la dynamique évolutive spatiotemporelle des NoV GII.4 circulant à l'échelle mondiale en utilisant une approche bayésienne, des analyses phylogéographiques et des schémas de migration sur un ensemble de données de séquences VP1 complètes représentant chacune des variantes de GII.4. Résultats : Le taux d'évolution moyen estimé pour GII.4 VP1 était de 5,1x10-3 substitutions de nucléotides par site et par an (sous/site/an), le temps jusqu'à l'ancêtre commun le plus récent (tMRCA) était d'environ 1971, et la localisation ancestrale la plus probable était les États-Unis d'Amérique (USA). Les quatorze variants connus de GII.4 ont affiché des taux d'évolution variables (4,5–7,4x10-3 sub/site/an) et tMRCA (~1984 à ~2006), la majorité ayant les États-Unis/Asie comme lieu ancestral. L'analyse des schémas de migration a indiqué le rôle important de l'Australie-Nouvelle-Zélande, de l'Inde et de l'Europe du Sud dans la dispersion mondiale des norovirus GII.4. Conclusion : L'étude contribue à la compréhension de la dynamique évolutive du norovirus GII.4.