Журнал лекарственного метаболизма и токсикологии
Открытый доступ
ISSN: 2157-7609
ISSN: 2157-7609
Мохан Кумар, Махима Кошик, Свати Чаудхари и Шрикант Кукрети
Двойная спиральная структура ДНК предлагает различные сайты связывания для взаимодействия лигандов или белков. Взаимодействия с использованием малой бороздки, большой бороздки и посредством интеркаляции являются основными типами механизмов связывания взаимодействий ДНК-лиганд. Снижение интенсивности поглощения вместе с батохромным сдвигом является указанием на интеркаляционный режим связывания красителя в пары оснований ДНК. В этом исследовании взаимодействие фенотиазиновых красителей с ДНК теленка-тимуса (ctDNA) в физиологическом буфере (pH 7,4) изучалось с использованием УФ-видимой, флуоресцентной, круговой дихроизма (CD) и УФ-термической денатурационной спектроскопии. Константы связывания рассчитывались при различных температурах с помощью флуоресцентной спектроскопии. Сигналы CD означают, что B-форма ДНК может стать более компактной при связывании красителей. Также наблюдается индуцированный круговой дихроизм, что подтверждает образование комплекса краситель-ДНК. Стабилизация двойной спирали ДНК при связывании с красителями была подтверждена увеличением Tm ctDNA. На основе профилей термического плавления было обнаружено, что ацетат тионина является наиболее перспективным для стабилизации двойной спирали ДНК по сравнению с двумя другими красителями. Кроме того, константы связывания, рассчитанные с помощью флуоресценции, соответствуют анализу термического плавления. Эти результаты указывают на интеркаляционный режим связывания между красителями и ДНК. Установлено, что сродство связывания красителей с ДНК имеет следующий порядок: ацетат тионина > азур А > азур В. Такие предварительные исследования облегчают наше понимание различных типов взаимодействий ДНК-лиганд и дают подсказки для разработки новых и более эффективных лекарств.