Достижения в области генной инженерии
Открытый доступ

Абстрактный

Подтипирование глиомы путем объединения данных экспрессии генов и CNV на основе подхода компрессионного зондирования

Вэньлун Тан, Хунбао Цао, Цзи-Ган Чжан, Цзюньбо Дуань, Дундонг Линь и Ю-Пин Ван

Осознано, что комбинированный анализ различных типов геномных измерений, как правило, дает более
надежные результаты классификации. Однако, как эффективно объединить данные с различным разрешением, является сложной задачей. Мы предлагаем новый подход на основе сжатого зондирования для комбинированного анализа данных экспрессии генов и вариантов числа копий с целью подтипирования шести типов глиом. Экспериментальные результаты показывают, что предлагаемый комбинированный подход может существенно повысить точность классификации по сравнению с использованием любого из отдельных типов данных. Предлагаемый подход может быть применим ко многим другим типам геномных данных.