Гинекология и акушерство
Открытый доступ

Абстрактный

Использование профилирования мРНК на основе крови для выявления биомаркеров для скрининга рака яичников

Сэмюэл Си Мок, Джэ-Хун Ким, Стивен Джей Скейтс, Джон О Шордж, Дэниел В. Крамер, Карен Х Лу, Чун-Чин Лью

Цель: Определить потенциальные геномные сигнатуры для раннего выявления рака яичников с использованием профилей экспрессии генов на основе цельной крови.

Экспериментальный дизайн: Мы провели анализы микрочипов Affymetrix U133Plus 2.0 GeneChip на образцах РНК цельной крови, полученных от 14 пациентов с раком яичников и 15 здоровых женщин соответствующего возраста. Гены, дифференцированно экспрессирующиеся, были идентифицированы с помощью параметрического t-критерия Уэлча. Анализы ОТ-ПЦР в реальном времени были выполнены на РНК, полученной от 96 пациентов с раком яичников и 83 здоровых женщин соответствующего возраста, с использованием наборов праймеров, специфичных для 14 генов. Тест Манна-Уитни U оценивал значимость отдельных генов. Уровни CA125 определялись в том же наборе образцов. Мы использовали анализ логистической регрессии и перекрестную проверку для оценки способности линейных комбинаций специфических транскриптов в сочетании с CA125 отличать рак от контроля.

Результаты: Анализы микрочипов показали, что 9583 зонда значительно отличались в профилях экспрессии генов в крови здоровых женщин по сравнению с пациентами с раком яичников (p < 0,05). Анализы ОТ-ПЦР в реальном времени в 96 случаях и 83 контрольных группах подтвердили 7 генов, которые показали значительно различающиеся уровни экспрессии в случаях и контрольных группах. Логистический регрессионный анализ и перекрестная проверка определили оптимальную панель маркеров, включая CA125, BRCA1 и KIAA0562, которые могли бы повысить чувствительность одного CA125 до более чем 90% при 98% специфичности при выявлении рака яичников на ранней стадии.

Заключение: Профили экспрессии генов циркулирующей крови идентифицировали РНК-маркеры, которые могут улучшить чувствительность CA125 при выявлении рака яичников на ранней стадии. Дальнейшая валидация необходима для подтверждения клинической полезности этих биомаркеров.